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【R言語】統計解析フリーソフトR 第4章【GNU R】



1 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2011/01/09(日) 17:31:49 ]
R は統計計算とグラフィックスのための言語・環境です。
統計計算で重宝するデータ型や、複数要素を処理する演算や関数、
解析結果を表示するグラフィックなど、多彩な機能を提供します。

●関連サイト
The R Project
www.r-project.org/
RjpWiki
www.okada.jp.org/RWiki/
リンク集
www.okada.jp.org/RWiki/?%A5%EA%A5%F3%A5%AF%BD%B8

552 名前:551 mailto:sage [2012/06/04(月) 19:07:14.04 ]
こっちのほうがいいかも
> unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target, value=TRUE))))
[1] "abaa" "abef" "aefe"



553 名前:542 mailto:sage [2012/06/04(月) 19:39:49.43 ]
>>552 は、target内の要素が相異なることが前提になりますね。

あとは、target内の要素の順序を保つようにならないものかな。


554 名前:542 mailto:sage [2012/06/04(月) 19:47:57.32 ]
まあ、ソートすればOKと。

pattern <- c("ab","ef"); target <- c("abaa","abef","aefe","cafe","abef")

target[sort(unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))]


555 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/04(月) 19:49:05.43 ]
>>551, 552
あぁ、そうだね。
わざわざ1:lenght(pattern)でやるより、簡潔にsapply(pattern, function(x) ...)でよかった。
ご指摘ありがとう。

> target <- apply(matrix(sample(letters[1:6], 4 * 10000, replace = TRUE), ncol = 4), 1, paste, collapse = '')
> pattern <- c("ab","ef")

> system.time(target[unique(unlist(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))])
ユーザ システム 経過
0.004 0.000 0.005
> system.time(unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target, value=TRUE)))))
ユーザ システム 経過
0.004 0.000 0.007

速度的にはあまり変わらないみたいだが。


556 名前:542 mailto:sage [2012/06/04(月) 21:20:11.29 ]
ミスがありました。>>553 は unlist しないと駄目でした。
target[sort(unique(unlist(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))]

あと、greplを使えないかなと思い、>>555 氏の方法でランダム生成した
サイズ 10000 の target に対し、
target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)]
を適用してみましたが、apply系の関数を2重に使うと、当たり前ですが
遅くなりますね。
> pattern <- c("ab","ef")
> target <- apply(matrix(sample(letters[1:6], 4 * 10000, replace = TRUE), ncol = 4), 1, paste, collapse = '')
> system.time(target[unique(unlist(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))])
user system elapsed
0.01 0.00 0.02
> system.time(target[sort(unique(unlist(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))])
user system elapsed
0.02 0.00 0.02
> system.time(target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)])
user system elapsed
0.05 0.00 0.05


557 名前:542 mailto:sage [2012/06/04(月) 21:46:39.76 ]
rowSums は apply(x,1,sum) のエイリアスだと思ってたら、
rowSums のほうが、だいぶ速いんだね。知らなかったよ。
> system.time(target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)])
user system elapsed
0.05 0.00 0.05
> system.time(target[as.logical(rowSums(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target))))])
user system elapsed
0.01 0.00 0.02


558 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/04(月) 21:52:36.36 ]
>>557
投稿しようとしたら書かれてた
rowSumsはCで書かれてるはず
lapplyも同様
sapplyはlapplyを呼んでいる
applyはRで書かれていて遅い

559 名前:542 mailto:sage [2012/06/04(月) 22:04:53.47 ]
>>558
へえ。applyは、なるべく避けた方が良さげですね。勉強になりました。


560 名前:132人目の素数さん [2012/06/04(月) 23:15:00.88 ]
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      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
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561 名前:132人目の素数さん [2012/06/05(火) 07:03:58.00 ]
R.exeのインストールされていないwindowsPCで、R言語で書かれた
プログラムを実行する手段はありますでしょうか。
(Fortranの実行ファイルみたいなイメージです)

562 名前:132人目の素数さん [2012/06/05(火) 07:09:23.62 ]
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563 名前:132人目の素数さん [2012/06/05(火) 15:37:11.75 ]
SAS使用歴20年、R半年の者です。
RにはSASで言うところのマクロみたいな物はないでしょうか?

564 名前:132人目の素数さん [2012/06/05(火) 20:30:53.61 ]
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565 名前:132人目の素数さん [2012/06/05(火) 22:40:37.65 ]
R2.15.0でRODBCとXLConnectを同時に使用しようとすると名前空間エラーがでませんか?

566 名前:132人目の素数さん [2012/06/06(水) 00:22:27.48 ]
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567 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/07(木) 09:54:47.13 ]
放置されて可哀想なので、私には答える能力がないけど、答えてみる。

>>561
?compiler::compile
このあたりを入り口に文献を読んでみて。
ところで、R.exeが入ってなくても、R.dllは入れてもいいの?
やりたいことを達成するには、Cなどで書いて、
R.dllが一緒にインストールされるソフトを作成する必要がある気がする。

>>563
SASはほとんど使った経験がないから、回答する資格がないけど、
R言語そのものがRのマクロとも言えます。
お手元のR入門書の「関数化」の項を読んでみてください。

>>565
異なる作者による同じ目的のパッケージだと、そのようなことは起こるかも知れません。
何千もある投稿パッケージの全てにおいて整合性がとれているわけではありません。
再現性が確認できたら、RODBCとXLConnectのメンテナに報告するとよいでしょう。

568 名前:132人目の素数さん [2012/06/09(土) 23:34:52.27 ]
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569 名前:132人目の素数さん [2012/06/10(日) 06:29:56.30 ]
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570 名前:132人目の素数さん [2012/06/13(水) 20:54:59.86 ]
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571 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/18(月) 14:21:06.94 ]
Rjpwikiの「Rだけでデータクリーニング」。
真摯な回答をする人が何人もいて、偉いな。

572 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/22(金) 16:40:13.73 ]
荒らされていてここじゃ書きずらくないですか?
Rってプログラミング言語なのでプログラムスレッドに移住するそうですよ。
無理にとは言わないので出来たらお願いしますね。

統計解析R たぶんpart3くらい
toro.2ch.net/test/read.cgi/tech/1340339592/

573 名前:132人目の素数さん [2012/06/24(日) 14:58:20.27 ]
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
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     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
    |      / `‐-、::::::::::`‐-、::::\   /,ニニ、\            それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら?
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574 名前:542 mailto:sage [2012/06/27(水) 21:28:07.95 ]
sqldf package が便利なことに気付いた。


575 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/27(水) 22:14:18.48 ]
OpenOffice Calcのファイル.odsから直接Rのデーターフレームに
読み込む方法はないかなあ。
cvsに変換して読み込んでいるけど、ちょっとだけメンドイ。

576 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/28(木) 13:28:01.62 ]
>>575
read.ods() from ROpenOffice
ttp://www.omegahat.org/ROpenOffice/

577 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/28(木) 16:25:13.46 ]
>>576
サンクス!
CRAN関連ばかり探していたから引っかからなかった訳だ。
ダウンロードして見たが、CRANじゃないのでインストール方法が判らん。
初心者なんでもうちょっと勉強してみる。

578 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/28(木) 16:40:01.10 ]
>>577
$ sudo R CMD INSTALL Rcompression_0.93-2.tar.gz ROpenOffice_0.4-0.tar.gz
でOK。

Rcompressionがない状態でROpenOfficeをインストールしようとすると、
$ sudo R CMD INSTALL ROpenOffice_0.4-0.tar.gz
* installing to library ‘/usr/local/lib/R/site-library’
ERROR: dependency ‘Rcompression’ is not available for package ‘ROpenOffice’
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/ROpenOffice’
とおこられちゃう。

Windowsで R CMD INSTALLを使う場合は、 別途Windows toolsetが必要らしい。
ttp://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#The-Windows-toolset

579 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/06/28(木) 17:39:04.25 ]
>>578
重ね重ね丁寧に答えていただき、有難うございます!

580 名前:132人目の素数さん [2012/07/02(月) 23:44:45.34 ]
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
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     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
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    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
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581 名前:575 mailto:sage [2012/07/04(水) 19:45:39.22 ]
Window toolsetがイマイチ判らず、ROpenOffice試せずにいたのですが、
Googleドキュメントのspreadsheetで read.csv("URL") から直接データーを
取り込めることを知り、色々試しているところです。
現時点では、spreadsheetのセル内に日本語使用すると、read.csv 失敗します。
英文字のみであれば、問題なく取り込めています。
バージョンの新しRだど2byte文字処理で不具合出るという話もあったので、
現状では出来るだけ日本語使用しないほうが良いみたいですね。

それから、Google spreadsheet をcsv形式でダウンロードしたファイルは、
Shift-JISにデコードし直さないと read.csv で取り込めませんでした。
UTF-8形式だったから読み込めなかったのかなあ。
まあそれでも Google spreadsheet が使えることが判ったので、
データー入力ツールはこれでいくことにします。

582 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/05(木) 09:17:17.75 ]
>>581
ヘルプぐらい読んでもよいと思うよ。
fileEncoding: character string: if non-empty declares the encoding used
on a file (not a connection) so the character data can be
re-encoded. See the ‘Encoding’ section of the help for
‘file’, the ‘R Data Import/Export Manual’ and ‘Note’.

encoding: encoding to be assumed for input strings. It is used to mark
character strings as known to be in Latin-1 or UTF-8 (see
‘Encoding’): it is not used to re-encode the input, but
allows R to handle encoded strings in their native encoding
(if one of those two). See ‘Value’.


583 名前:575 mailto:sage [2012/07/05(木) 19:39:30.67 ]
>>582
サンクスです! help読んでなかった・・・・
read.casv("file name", encording="UTF-8")で無事読み込めました。
これでだいぶ助かります。

584 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/11(水) 12:33:21.72 ]
ttp://www.facebook.com/tadashi.nagao
てっきり高校生か未熟な大学生と思っていたら、
案外おっさんだったw
老けて見えるだけかな。

何にせよ、某所には、公共性の高いものだけに絞って書き込んで、
それ以外は、ここ(2ch)に書き込んで欲しいぞ。

c(letters[1:26])とか、初心者や入門者を混乱させることを目的とした
嫌がらせとしか思えないぞ。

585 名前:132人目の素数さん [2012/07/20(金) 12:52:33.55 ]
Mac OSX, Cocoa 環境でアプリ内から/Library/Frameworks/R.framework/Resources/にある実行ファイルを叩いてRを使っています。
[ NSTask launch... ] といった感じです。

しかし、スクリプトの末尾にq()を付けてもRの実行ファイルが動いたままになります(アクティビティモニタで確認)。
NSTask のterminateを呼び出しても消えてくれません。

どうもこれが悪さをして意図した動作をしてくれ内容です。
対処方法ご存知のかたがいましたらご回答をお願いします。

586 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/20(金) 13:15:11.45 ]
>>585
q()の引数saveを省略すると"ask"になるのでは?
ヘルプには
| The default is to ask in interactive use but may be overridden by
| command-line arguments (which must be supplied in non-interactive
| use).
って書いてある。

つまり、実験せずに書くが、q()と書いても、入力待ちプロンプトで無限ループになってる気がするぞ。

587 名前:132人目の素数さん [2012/07/20(金) 13:52:36.69 ]
>>585
q("no")

とすれば、入力待ちにならないのでは?


588 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/20(金) 14:00:19.17 ]
レスありがとうございます。
q()の引数にnoを追加しましたが、依然挙動不審です。
どうもコマンド引数に < script.r と指定したスクリプトを読み込めない場合があるようです。
なんこれ? な状況ですが。
最小単位の構成から実験してみます。


589 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/20(金) 14:05:39.29 ]
>>585
いずれにせよ、q("no")やq("yes")は関係ない。
それらがなくても処理は終了する。
$ echo 'a <- 1' > /tmp/tmp.R
$ echo 'print(a)' >> /tmp/tmp.R
$ /Library/Frameworks/R.framework/Resources/R CMD BATCH /tmp/tmp.R out.txt
$ tail -7 out.txt
> a <- 1
> print(a)
[1] 1
>
> proc.time()
ユーザ システム 経過
0.825 0.051 1.074
ちゃんと終了する。

590 名前:589 mailto:sage [2012/07/20(金) 14:09:30.38 ]
あと、
$ ls -l $(which R)
lrwxr-xr-x 1 root wheel 47 4 27 16:45 /usr/bin/R -> /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R
だから、普通に
$ R CMD BATCH スクリプト 結果ファイル
でいいよ。



591 名前:馬鹿を焼く描写 ◆ghclfYsc82 mailto:age [2012/07/22(日) 16:58:54.77 ]
★★★学歴格差:無意味
★★★学力格差:尊重しろ
★★★能力格差:最大限利用せよ。
東大や京大にだって馬鹿は沢山居てるんだヨ。

学力格差と能力格差を認める理想社会を実現しろや。要するに:
★★★『馬鹿は無意味なので不必要だから、従って無能は静かにせよ。』★★★
っちゅうこっちゃ。低脳が騒ぐのはワシが許さんのや。

ちゃんと読め。




592 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/26(木) 09:47:52.47 ]
行列の作り方について質問です
xという1×n個の配列があって、
yという行列の要素を
y[i][j] = x[i]+x[j]としたいとき、
y行列を作る文はどのようにしたら良いのでしょうか


593 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/26(木) 10:44:18.59 ]
>>592
> n <- 10
> x <- 1:n + 10
> x
[1] 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
> outer(x, x, "+")
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
[1,] 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31
[2,] 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32
[3,] 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33
[4,] 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34
[5,] 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35
[6,] 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36
[7,] 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
[8,] 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38
[9,] 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39
[10,] 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40

こういうことか?

594 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/26(木) 11:55:59.91 ]
>>593さま
そうです!
ありがとうございます!
助かりました

595 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/07/26(木) 12:08:58.20 ]
>>594
助かったのなら何よりなんだけど、
宿題の類だったのなら、確認もせずに教育の邪魔をして教員に申し訳ない。

596 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/05(日) 22:25:40.52 ]
n=1,2,...,Nに対してP(n)のデータがあります
このデータがどの確率分布か言い当てることはできますか

597 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/05(日) 23:48:09.66 ]
>>596
これまた宿題っぽい。
質問の動機や、動機を得るに至った背景を説明してもらえますか

598 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/07(火) 01:02:34.43 ]
>>597
R触ってみようと思って最初に思い浮かんだのがこれ
なんだけど探しても見つからないもんだからここで聞くことにした

599 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/07(火) 04:10:01.29 ]
>>598
ググると「コルモゴロフ-スミルノフ検定」というのが出てきた。


600 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/07(火) 13:49:09.80 ]
>>596
>>599さんの答えだけだと、初心者はどうしてよいか分からないと思うので助言します。

> RSiteSearch("Kolmogorov-Smirnov")

以上。



601 名前:132人目の素数さん [2012/08/08(水) 15:54:24.83 ]
Mac版Rのデフォルトでのフォントって何でしたっけ?
コマンド入力中にうっかりよくわからないキー押してしまったみたいでフォントが変わってしまって・・。

602 名前:baka描 ◆ghclfYsc82 mailto:age [2012/08/08(水) 17:29:54.67 ]


>14 名前:132人目の素数さん :2012/08/07(火) 17:39:00.96
> >>13
> 旧コテ猫あらため描つまりお前自身の事だろ、増田哲也に限り無く近い人間。
> 筑波大学で痴漢と言えば増田哲也だから連続性も明らかになってるから
> わざわざ限り無く近い人間なんて呼び方しなくていいんだけどな
>


603 名前:132人目の素数さん [2012/08/08(水) 19:18:57.57 ]
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     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
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     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
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604 名前:132人目の素数さん [2012/08/08(水) 21:07:17.90 ]
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605 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/12(日) 19:33:37.42 ]
Rで、グラフとして描画されているデータをテキスト出力出来ますか?

Rを使える人が私以外いないので、
Excelで配布しなければなりません。

今は描画前の関数データを張り付けていますが、
縦軸が変わってしまうので、グラフ描画からそのまま出力したいと思っています。

606 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/13(月) 09:08:15.60 ]
>>605
意味が分からない。
> Rで、グラフとして描画されているデータをテキスト出力出来ますか?
Rグラフィックで描画するには、描画するためのデータがあると思うのだけど。
もしそうなら、そのままテキスト出力すればよいと思うが、
そんなことをわざわざ質問するとは思えないから、よく分からない。
テキスト出力とExcelの関連も意味不明。
> a <- data.frame(x=runif(10), y=runif(10))
というデータフレームがあったとして、
> plot(a)
とRグラフィックに描画して、次のようにすればテキスト出力される。
> a
x y
1 0.1401729 0.223354073
2 0.8426009 0.880151101
3 0.2795089 0.002605373
4 0.8179064 0.131089282
5 0.3903741 0.580761547
6 0.1708031 0.793535840
7 0.8964184 0.198217040
8 0.6109237 0.136335747
9 0.7519352 0.367561028
10 0.6382441 0.429468494


607 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/13(月) 09:53:15.56 ]
>>606
なるほど。データフレームにしてしまえばトラブルを解消できそうです。

今まで、xとyを別々に指定するような作業をしていたので気が付きませんでした。
ありがとうございました。

608 名前:132人目の素数さん [2012/08/26(日) 09:50:32.98 ]
教えてください。

開始日,数
1,5
2,2
3,4
4,8
……
30,5

のような時系列データの信頼区間やピークを求めたいのですが、
解説サイトとかないでしょうか。

609 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/08/27(月) 11:10:35.51 ]
>>608
ピークを得るためには、当てはめる関数の形が必要でしょう。
あなたの研究対象に対する先験的知識が本質的に必要だと思われます。

例えばポアソン分布に当てはめられるタイプのデータだと次のようになります。
d <- data.frame(x=1:30, y=round((dpois(1:30,10) + runif(30, max = 0.01))*100))
barplot(d$y, names.arg = 1:30)
こんなサンプルデータで、nls()を使って、
m1 <- nls(y ~ (a * (lambda^x*exp(-lambda)/gamma(x+1)) + b),
start = c(a = 1, b = 1, lambda = 10), data = d)
とすると、
> max(predict(m1))
[1] 13.14048
> which.max(predict(m1))
[1] 9
9日目で最大値13のピークになることが分かります。


610 名前:132人目の素数さん [2012/09/14(金) 21:05:08.72 ]
windowsXP世代の4GBマシンで100万レコードオーダーのdataframeを
ggplot2で描画しようとするとメモリオーバーになってしまう
なんかうまい方法はないものか



611 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/15(土) 00:15:23.75 ]
>>610
分割して描画すればどうなる?
ggplot2じゃないけど、例えばこんな風に。
> d <- data.frame(x = runif(100), y = runif(100))
> plot(d[1:25, ], xlim = range(d$x), ylim=range(d$y))
> points(d[26:50, ])
> points(d[51:75, ])
> points(d[76:100, ])

612 名前:132人目の素数さん [2012/09/15(土) 09:17:37.47 ]
>>611
どうもです
確かに仰る通り、::baseのplotならば可能です

後だしですんませんが
・見た目のキレイさ
(というか先進性というか凄いことやってそうに見せられるというか。。苦笑
・カテゴリカル変数20こ程度
・引き継ぎやデータ更新等を考えて
作図のためのデータハンドリングのコーディングは最少にしたい
・自分自身の興味w

のような趣旨でggplot2でやりたいのです

613 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/15(土) 20:06:17.90 ]
>>610
32bit?64bit?

614 名前:132人目の素数さん [2012/09/15(土) 21:09:24.15 ]
>>613
32bitです
会社の端末なんで詳細は不明ですが
5年くらい前の型で家庭用PCです
Rは2.15.0でパッケージは最新です
ggplot2_0.9.2.1


615 名前:132人目の素数さん [2012/09/15(土) 22:21:52.64 ]
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
      /   /:::::; -‐''"        `ーノ
     /   /:::::/           \
     /    /::::::/          | | |  |
     |   |:::::/ /     |  | | | |  |
      |   |::/ / / |  | ||  | | ,ハ .| ,ハ|
      |   |/ / / /| ,ハノ| /|ノレ,ニ|ル' 
     |   |  | / / レ',二、レ′ ,ィイ|゙/   私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
.     |   \ ∠イ  ,イイ|    ,`-' |      頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
    |      / `‐-、::::::::::`‐-、::::\   /,ニニ、\            それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら?
   |      |::::::::::::::::::|` -、:::::::,ヘ ̄|'、  ヒニ二、 \
.   |      /::::::::::::::::::|::::::::\/:::O`、::\   | '、   \
   |      /:::::::::::::::::::/:::::::::::::::::::::::::::::'、::::\ノ  ヽ、  |
  |      |:::::/:::::::::/:::::::::::::::::::::::::::::::::::'、',::::'、  /:\__/‐、
  |      |/:::::::::::/::::::::::::::::::::::::::::::::::O::| '、::| く::::::::::::: ̄|
   |     /_..-'´ ̄`ー-、:::::::::::::::::::::::::::::::::::|/:/`‐'::\;;;;;;;_|
   |    |/::::::::::::::::::::::\:::::::::::::::::::::::::::::|::/::::|::::/:::::::::::/
    |   /:::::::::::::::::::::::::::::::::|:::::::::::::::::::::O::|::|::::::|:::::::::::::::/

616 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/17(月) 13:49:31.71 ]
ggplotでも分割してできるでしょ。
それでも最後の描画の際にエラーになっちゃうかな?

617 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/18(火) 00:00:46.90 ]
>>616
はい。
ggplot2オブジェクトにそうさをくわえることはできますが、
プロットするさいにメモリオーバーエラーとなってしまいます。
(プロットせずにggsaveしようとしてもおなじです)

618 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/18(火) 14:41:03.61 ]
>>617
じゃあ、データを間引きするしか方法がないのでは?

そもそも100万レコードを視覚化するのに、
そのまま100万レコードが必要なのか?
100万からサンプリングして1万で図を描いても同じ図になる気がするぞ。

619 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/18(火) 23:07:04.27 ]
RにはReduce見たいな機能はないのかな

620 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/19(水) 00:02:17.70 ]
>>618
そういわれるとそうなのです

ただ、問題は>>617なので、なぜそうなるのか分かって、
そこだけ回避できるようになれればよいのですが・・・




621 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/19(水) 09:39:21.27 ]
そもそも全部描画できたとして、それは見るに耐えるものなのか?
例えば散布図なんかだと100万点どころか、1万点ですら多すぎて見づらいから、適切に間引くのが普通だ。

622 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/20(木) 10:57:36.08 ]
>>620
症状から考えて
ggplot2内部的に、
画面表示や画像ファイル保存などの描画時に、
データフレームをSVGみたいな描画用データに変換してから
その描画用データを参照して描画するんだと思う
だから、100万データを扱うことはできても、
グラフ描画(保存も含む)ができない。
しかも、データをどれだけ分割しようと
最終的に描画する際には、
そのグラフに使用する全描画用データを
同時にメモリに保持している必要があるから、
分割が意味をなさない。

だから、どうしても100万データ分使いたいんだったら、
メモリオーバーしない量のデータで一旦画像に保存して、
その画像同士を重ね合わせるみたいな方法をとるしかないかな。
画像処理の手間が必要になりますが。

あるいは、グラフ用のデータを
ダイナミックアロケーションできるような方法が
あるのか知りませんが、なければ作るとか……w

623 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/20(木) 16:26:54.47 ]
>>622
そうだな。>>622の言うとおり、ベクタ構造を保持するからメモリ不足になる。
適当なインターバルでラスタ変換をかませればよろし。
png()で分割出力して、system("convert ...")で重ねる。

624 名前:132人目の素数さん [2012/09/20(木) 22:19:32.83 ]
>>622
>>623
なるほど頭の中が整理されました!

・データの分布を壊さずにデータを間引く関数を作る
・分割描画して最後にラスタデータを統合する関数を作る
・高スペックPCを導入する()
のどれかって感じですね!

ちょっと試してみるデス

625 名前:625 mailto:sage [2012/09/21(金) 00:01:09.50 ]
√625 = 25


626 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/26(水) 20:01:39.27 ]
質問です。
任意の行列xを縦に複数回並べたいです。
こんな感じで書いてみたのですが、
forを使わず作れますか、
rep関数だけで実現できないですか?


mat <- NULL
x <- matrix(1:9, 3, 3)
for(i in 1:5){
mat <- rbind(mat,x)
}
mat



627 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/26(水) 22:27:54.77 ]
>>626
>rep関数だけで実現できないですか?
できる

ヒント:
> i <- 5; paste("rbind(", paste(rep("x", i), collapse = ","), ")")
[1] "rbind( x,x,x,x,x )"


628 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/26(水) 23:09:49.40 ]
Reduce(rbind,lapply(1:5,function(x) matrix(1:9,3,3)))

629 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/09/26(水) 23:40:06.82 ]
>>627-628 ありがとうございます\(^o^)/

630 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/01(月) 04:48:45.78 ]
>>628
do.call(rbind,lapply(1:5,function(x) matrix(1:9,3)))
5回じゃなくてもっと沢山くっつけるならdo.callのほうが速いみたい



631 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/01(月) 23:26:00.72 ]
Rってこれから主流になるんですか?
ビッグデータ界隈でR!R!R!騒がしいです。

632 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/02(火) 12:27:05.94 ]
主流になるのではないかと言われているけど、必ずそうなるとは言い切れない。
でも使えておいて損はないと思うよ。

633 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/02(火) 15:05:16.56 ]
>>631
ビッグデータって何GBくらい?

素朴に考えると、Rらしいプログラムの書き方で処理するときには、
データを全てPCのメモリ上に読み込まなければならない。

しかし、オラクルに格納されたデータが、
PC1台のメモリにスッポリ収まるとはとうてい考えられない。

634 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/02(火) 19:43:58.58 ]
>>633
それは時代遅れ。大規模なデータ処理では、データを固定したまま
処理をおこなう処理系自体をデータのあるところに移動しないと間に合わない。

既に昨年、Oracle社はデータはRDBMS上においたまま Rのコードを
実行できる仕組みを提案してるよ。フロントエンドはRで、実行はRDBMSか、
おそらく Exadata という専用ハードの上で行うと思う。

ttps://blogs.oracle.com/dbjp/entry/bigdata_000217

635 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/02(火) 20:20:33.97 ]
>>634
なるほど、オラクルサーバがR(互換)インタプリタを内蔵しているというわけですか。
Rが凄いというよりもORACLEの商魂が凄い。

そういえば、DBMSや統計ソフトのベンダーが
「顧客のニーズを読めてませんでした」とか言ったらギャグになる。

636 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/03(水) 20:37:17.21 ]
>>634
その手の話はOracleに限った話ではない
www.revolutionanalytics.com/products/revolution-enterprise-for-ibm-netezza.php

と言うより、Oracle使ってた人がRなんか使うのかね?
そういう人はSASとか使うような気がするが。

637 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/03(水) 22:48:32.44 ]
>>636
うちはOracleとRを使ってる。会社のデータはOracleで管理してるが、
それを可視化したり、対話的に解析するのにRが便利。
両者はODBCデータソース経由でシームレスに繋がる。

確かにSASはいいんだけどライセンス料金が高いので使える人が
限られてしまうが、Rならそういうこと気にせずに済むのがいい。
ただしRはサポートが課題になりやすいけどね。

もしOracleが有償でもRのサポート提供するなら、それを評価する
企業ユーザもいるんじゃないかな?

638 名前:132人目の素数さん [2012/10/03(水) 23:16:24.69 ]
Rで分析が済ませるデータ量の会社はそれでもいいけど、そんな会社はDB側もAccessで十分そうね。

639 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/03(水) 23:33:39.40 ]
Rでは社内で解析したものを環境丸ごと渡して
加工してもらうこともできるのかな?

640 名前:132人目の素数さん [2012/10/03(水) 23:44:58.20 ]
データサイエンティストとして経験を積むにはどの業界が良いのだろうか?
色々考えてみた。

SNS データ量が多い。分析前提でDBが設計してある。データドリブンが前提
銀行 顧客属性、預貯金データ保有、ローン情報
保険 顧客属性、病歴情報保有
クレジットカード 顧客属性、ローン情報、購買データ保有

SNSかクレジットカードだろうか。



641 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/03(水) 23:53:37.59 ]
Tポイントカードの新会社だろ、JK!w

642 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/03(水) 23:56:05.36 ]
POSデータがあれば、どこでもおk

643 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/04(木) 00:01:14.41 ]
Tポイントカード、POSデータの情報量なんてたかが知れてると思うな。

644 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/04(木) 00:28:41.27 ]
>>637
SASのライセンス料を気にしてOracleのライセンス料を気にしないのは謎だな
Oracleでまともにビッグデータを扱うと千万円の単位では済まないのに…

645 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/04(木) 15:32:50.43 ]
企業のことは分からないが、
PostgreSQL + Rという組み合わせは論外なのかな?

646 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/04(木) 20:11:25.61 ]
>>645
PostgreSQLはBSDライセンスで、RはGPLじゃなかったっけ?
言語処理系部分の流用は出来ないんじゃないの?

647 名前:132人目の素数さん [2012/10/04(木) 21:31:10.07 ]
>>644
Oracle は基幹系の投資に含めやすいし、実際に支払うライセンス料は
年間サポート料やコンサル費に比べれば大した金額じゃないと思う。
むしろコンサル費がべらぼうに高い。

その延長でゆくと、分析ツールはSASでもRでもいいが、こういう分析ツールを
活用できる社員を育成するのに金が掛かるし、企業での課題だと思う。
ちょっと外れてきたね。

648 名前:132人目の素数さん [2012/10/04(木) 22:57:30.45 ]
Postgre + R だと生データを直接処理(モデリング)できないでしょ。
それこそ、MapReduceみたいな処理の分散を自分で考えないといけない。

649 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/05(金) 00:20:41.39 ]
>>626
x <- matrix(1:9, 3)
x[rep(1:3,5),]

650 名前:132人目の素数さん mailto:sage [2012/10/05(金) 01:07:56.33 ]
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
      /   /:::::; -‐''"        `ーノ
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      |   |/ / / /| ,ハノ| /|ノレ,ニ|ル' 
     |   |  | / / レ',二、レ′ ,ィイ|゙/   私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
.     |   \ ∠イ  ,イイ|    ,`-' |      頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
    |      / `‐-、::::::::::`‐-、::::\   /,ニニ、\            それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら?
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651 名前:132人目の素数さん [2012/10/08(月) 17:00:48.41 ]
SNSの出身の人はビジネスセンスに欠ける気がする。
もしかしたら、それは旧時代的なビジネスセンスで、SNS出身の人のは新時代のものかもしれないけど。

・・・ないな。

652 名前:132人目の素数さん [2012/10/08(月) 17:29:34.67 ]
頭の古い人はいつでも置き去りにされる。






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