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【R言語】統計解析フリーソフトＲ 第４章【GNU R】

1 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2011/01/09(日) 17:31:49 ]
R は統計計算とグラフィックスのための言語・環境です。
統計計算で重宝するデータ型や、複数要素を処理する演算や関数、
解析結果を表示するグラフィックなど、多彩な機能を提供します。

●関連サイト
The R Project
www.r-project.org/
RjpWiki
www.okada.jp.org/RWiki/
リンク集
www.okada.jp.org/RWiki/?%A5%EA%A5%F3%A5%AF%BD%B8

477 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/27(金) 20:26:45.89 ]
?write.table

478 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/27(金) 21:07:02.32 ]
>>476
真に必要がないのに、[, 1]などを削るのはいかがかと思うが、
次のようにすればどうだろう。
> x<-c(2, 3, 5, 4, 7, 9, 10, 2, 3, 4, 5)
> z<-c(3, 5, 9, 7, 13, 17, 19, 3, 5, 7, 9)
> y<-c(4, 6, 10, 8, 14, 18, 20, 4, 6, 8, 10)
> hoge <- function(x){
+ n <- nrow(x)
+ l <- rownames(x)
+ for(i in 1:n){
+ cat(paste(l[i], "\t"), fill = FALSE)
+ cat(x[i, ], fill = TRUE)
+ }
+ }
> hoge(rbind(x,y,z))
x 2 3 5 4 7 9 10 2 3 4 5
y 4 6 10 8 14 18 20 4 6 8 10
z 3 5 9 7 13 17 19 3 5 7 9

479 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/27(金) 23:02:47.19 ]
>>477-478
ありがとうございます。ここまで対応して下さり感謝します。

480 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 02:07:58.56 ]
rを外部から操作する環境設定について質問します
gnupack gnupack.sourceforge.jp/docs/latest/UsersGuide.htmlのemacsを使って居ます
ESS (www.okada.jp.org/RWiki/?ESS)経由でRを利用しているのですが、
割合<-1/3
と書くと
「構文解析中に不正なマルチバイト文字列がありました」
とエラーになります
RGuiのR Consoleからはそういうエラーはでません。

割合の"合"が原因のようで、ESSのやりとりではsjisとして文字コードが解釈されてしまうため、R側が適切に認識できないような気がします。
emacsからRをutf-8で操作できれば問題は解消すると思うのですが、どのように設定することになりますか。

481 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 05:34:39.27 ]
presiceきたー
ttp://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/

482 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 08:45:12.17 ]
>>480
お客さん、Emacsは初めて？
ttp://tanuzou.com/nuzou/wiki/index.php?emacs%A4%C7%A4%CE%CA%B8%BB%FA%A5%B3%A1%BC%A5%C9%CA%D1%B9%B9

483 名前：480 mailto:sage [2012/04/28(土) 09:53:19.07 ]
>>482
いえ、はじめてではないです
set-buffer-process-coding-systemで
outputをutf-8にすれば入力は問題無くなるのですが、
今度は出力がおかしくなります
例えば、「 作業スペースを保存しますか? [y/n/c]: 」というメッセージは
?X y [ X ? ? ? [y/n/c]:
こうなってしまいます
set-buffer-process-coding-systemのinputをutf-8にしてもそうなったままです


484 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 10:46:30.19 ]
c <- 3:13
f <- c(1, 12, 19, 6, 15, 10, 2, 18, 15, 9)

cを階級値、fを度数としてヒストグラムを書きたいのですが、
barplot(f,names.arg=c,space=0)
こうしてヒストグラムを書いたときに0,5,10,15の横線を左から右端まで引く方法はありますか。

またc("101-120", "121-140", "141-160"...)というように、
階級値ではなく階級境界値が与えられたとき、
同じようにヒストグラムを書く方法があれば知りたいです。
その場合にstrsplit()を使って文字列を分割するということは考えたのですが、
その先がわかりませんでした。

485 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 11:02:42.35 ]
>>484
前半の方は無理じゃないかな



486 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 12:49:02.44 ]
c <- 3:13
f <- c(1, 12, 19, 6, 15, 10, 2, 18, 15, 9, 1)
x <- c()

for(i in 1:length(f)){
x<-append(x,rep(c[i],f[i]))
}
dx <- data.frame(x=x)

library(ggplot2)
ggplot(dx, aes(x))+ geom_bar(binwidth=1) + geom_hline(yintercept=seq(0,15, by=5))



487 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 13:02:37.47 ]
>>483
これで直るんじゃないかな。
rmecab.jp/wiki/index.php?R%A4%CE%C8%F7%CB%BA%CF%BF#v2acbd2d
Rの側では何も設定しなくて大丈夫だから、設定はNTEmacsスレで聞いた方がいいかと。

488 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 13:13:33.53 ]
>>484
abline(h = seq(0, 15 , 5))

ってこと。ちなみにcは関数名なので、代入するとおかしくならない？

489 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 13:21:10.49 ]
c でも t でも変数名、ベクトル名に使えるけど、紛らわしいからやらないほうが吉

490 名前：374 mailto:sage [2012/04/28(土) 19:16:35.57 ]
>>484　下の方
どうせ、「なんちゃって」ヒストグラムなんだから、そのままでもいいじゃん。ダメなの?
barplot(f, names.arg=c("101-120", "121-140", "141-160"...), space=0)


それだとあんまりなので、こんな感じ?
f <- c(1, 12, 19, 6, 15, 10, 2, 18, 15, 9)
a <- paste(seq(from = 101, by = 20, along.with = f), sep="-", seq(from = 120, by = 20, along.with = f))
# => [1] "101-120" "121-140" "141-160" "161-180" "181-200" "201-220" "221-240" "241-260" "261-280" "281-300"
c <- sapply(a, function(x) as.numeric(unlist(strsplit(x, "-")))[2])
dist <- c()
for (i in 1:length(c)) {dist <- c(dist, rep(c[i]-1, f[i]))}
hist(dist)

491 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 20:38:01.56 ]
放大でRで統計やってたね

492 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/28(土) 23:15:54.50 ]
放送大学 授業科目案内 データからの知識発見（'12）

www.ouj.ac.jp/hp/kamoku/H24/kyouyou/A/sangyo/s_1554522.html
これかな
これぐらいの内容をざっと教えているのはいいね

493 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/29(日) 11:21:12.19 ]
binary <- c(T,F)
binaries <- data.frame("1st"=binary)
cbind(binaries,"2nd"=binary,"3rd"=binary)

X1st 2nd 3rd
1 TRUE TRUE TRUE
2 FALSE FALSE FALSE

このデータの順列すべてつまり2^3個分を表示したいのですが、
どうすればいいですか。
TRUE,TRUE,TRUE
TRUE,TRUE,FALSE
TRUE,FALSE,TRUE
TRUE,FALSE,FALSE
こんな風にです

494 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/29(日) 15:04:56.43 ]
>>493

library(gtools)
permutations(2, 3, c(T, F), repeats.allowed=TRUE)[8:1,]


495 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/30(月) 00:13:16.11 ]
>>494
ありがとうございます！まさにそれです。
permutation、ずばり順列そのもののコマンドがあるのですか。
勉強になりました。



496 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/03(木) 20:30:15.24 ]
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　　　　 | 　　　　l＾,人| 　` `-' 　 　 ゝ　 |　　　　　　　　さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
　 　 　 | 　　　　 ` -'＼　　　 　 　ｰ' 　人　　　　　　　　　　一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
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497 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/05(土) 22:45:04.63 ]
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498 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/06(日) 13:20:53.64 ]
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499 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/06(日) 16:50:58.01 ]
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500 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/08(火) 14:04:54.27 ]
RMeCabこんな感じに文字化けしちゃう

========================
險伜捷
"私は彼女のこ\x82"
========================


SetLocaleしてみた
============================
> Sys.getlocale
LC_COLLATE=Japanese_Japan.932;LC_CTYPE=Japanese_Japan.932;LC_MONETARY=Japanese_Japan.932;LC_NUMERIC=C;LC_TIME=Japanese_Japan.932"

> Sys.setlocale("LC_CTYPE","ja_JP.UTF-8")
警告メッセージ：
In Sys.setlocale("LC_CTYPE", "ja_JP.UTF-8") :
ロケールを "ja_JP.UTF-8" に設定せよとのOS のレポート要求は受け入れられません
==================================

なんかUTF-8に変えられないんだよね
環境はWin7/64bitです

だれか解決策教えて下さいな

501 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/08(火) 14:06:53.60 ]
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502 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/08(火) 14:07:16.16 ]
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503 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/08(火) 14:32:23.18 ]
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504 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/08(火) 19:17:29.11 ]
>>500
Rとは関係なしにMeCabが使える状態なのかどうかは確認した？
RMeCabはRの中からMeCabをただ単にcallしているだけなので、
そもそもMeCabが使えなかったら、RMeCabも使えない。

505 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/08(火) 19:44:31.59 ]
　　　　　　　　　　__ﾉ)-'´￣￣`ｰ- ､_
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　　　　 | 　　　　l＾,人| 　` `-' 　 　 ゝ　 |　　　　　　　　さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
　 　 　 | 　　　　 ` -'＼　　　 　 　ｰ' 　人　　　　　　　　　　一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
　　　　|　　　　　　　 /(l 　　 　＿＿／　 ヽ、　　　　　　　　　　　良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
　　 　 |　　　　　　　（:::::`‐-､__ 　|::::`､ 　 　 ﾋﾆﾆヽ、　　　　　　　　　あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
　 　　|　　　　　　／ `‐-､::::::::::`‐-､::::＼　　 /,ﾆﾆ､＼　　　　　　　　　　　　それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら？
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506 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/09(水) 12:16:57.42 ]
>>504
コマンドプロンプト上からMeCab自体はつかえてるっぽいけど文字化けしてる
===============================
> 私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
私は只の数ヲ 險伜捷,荳€闊ｬ,*,*,*,*,*
^ 蜷崎ｩ・繧ｵ螟画磁邯・*,*,*,*,*
險伜捷,荳€闊ｬ,*,*,*,*,*
ﾈ 蜷崎ｩ・蝗ｺ譛牙錐隧・邨・ｹ・*,*,*,*
ｩ 險伜捷,荳€闊ｬ,*,*,*,*,*
ﾆ 蜷崎ｩ・蝗ｺ譛牙錐隧・邨・ｹ・*,*,*,*
ﾍ 險伜捷,荳€闊ｬ,*,*,*,*,*
t 蜷崎ｩ・蝗ｺ譛牙錐隧・邨・ｹ・*,*,*,*
き合わないわ。 險伜捷,荳€闊ｬ,*,*,*,*,*
============================

CMDの文字コードがShift-JISで、MeCabがutf-8版だから
こうなるのはわかるんだけど
============================
932 (ANSI/OEM - 日本語 Shift-JIS)
============================


507 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/09(水) 13:04:31.70 ]
>>506
Windowsのことはよくわからないけど、
コマンドプロンプトをuft-8になんとかして変更するとか（utf-8な代替ソフトを使うとか）、
MeCabに喰わせる前後で、nkfをかましてUTF-8/CP932の変換を行うとか、
MeCabを使うときだけ、文字化けしない環境(MacOSXやLinux）を使うとか、
真に解決しなければならないものなら、試す価値のある方法はたくさんありそうだ。

あと、SDOUTで文字化けするなら、ファイルにリダイレクトして、
UTF-8を扱えるテキストエディタで開くと文字化けしないのかどうかチェックすることも必要では？

508 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/09(水) 14:15:31.27 ]
>>507
標準出力して、utf8形式でエディタ(TeraPad)にファイルを読み込んでみたら
なんと一部の文字列が文字化けしてました。MeCabの出力がutf-8ではないのか？
==========================
> echo "頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。 " | mecab > out.txt
==========================

Terapadでout.txtをutf-8形式で読み込んでみた
===========================
" 名詞,サ変接続,*,*,*,*,*
?a?a? 記号,一般,*,*,*,*,*
? 名詞,固有名詞,組織,*,*,*,*
-? 記号,一般,*,*,*,*,*
? 名詞,固有名詞,組織,*,*,*,*
?? 記号,一般,*,*,*,*,*
w 名詞,固有名詞,組織,*,*,*,*
?a? 記号,一般,*,*,*,*,*
- 略 -
EOS
=========================
Terapadで対応している他のコード(Shift-JIS,JIS,EUC,Unicode)でも
読み込んでみましたが、Utf-8以外だと文字化けしまくってました。

Win7のコマンドプロンプトをutf-8に変更するのは、たしかレジストリを弄る必要あったな
sgry.jp/blog/2011/06/26/475/
あとでやってみます

nkfをかませる方法だとRMeCabのソースに書き加えて再ビルドするかんじですか？
それともR側にそういうオプションがあったりします？

509 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/09(水) 14:37:47.21 ]
(続き)
>>507
さっきの文字化けの原因、わかりました。
"頭が良くて数学が～"の文字列がCP932なのにMeCabに読み込ませていたからでした。
CMDをutf-8にしてもう一度出力してエディタで開いてみたところ
========================
" 名詞,サ変接続,*,*,*,*,*
頭 名詞,一般,*,*,*,*,頭,アタマ,アタマ
が 助詞,格助詞,一般,*,*,*,が,ガ,ガ
良く 形容詞,自立,*,*,形容詞・アウオ段,連用テ接続,良い,ヨク,ヨク
て 助詞,接続助詞,*,*,*,*,て,テ,テ
数学 名詞,一般,*,*,*,*,数学,スウガク,スーガク
が 助詞,格助詞,一般,*,*,*,が,ガ,ガ
出来 動詞,自立,*,*,一段,連用形,出来る,デキ,デキ
- 略 -
EOS
=========================
正常に表示されました。やったね。

つぎはRとMeCabのオプション調べてみます。
作業はなるべくWin7で完結させたいです。

510 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/09(水) 15:36:01.63 ]
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511 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/09(水) 20:12:11.20 ]
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512 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/09(水) 21:04:27.28 ]
>>500
基底

513 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/18(金) 01:25:32.37 ]
b <- rbind(1:2)
c <- cbind(1:2)
b+c
このような感じで
2 3
3 4
こういう結果を出すような方法はありますか？
このまま実行したら
>以下にエラー b + c : 適切な配列ではありません
と出ました

514 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/18(金) 05:42:13.21 ]
cbind(c,c) + rbind(b,b)

515 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/18(金) 13:45:22.19 ]
>>514
ちょっ、b, cは最高に単純化した例だろw

> outer(b,c,"+")
, , 1, 1

[,1] [,2]
[1,] 2 3

, , 2, 1

[,1] [,2]
[1,] 3 4
となるけど、
> d1 <- 1:2
> d2 <- 1:2
> outer(d1,d2,"+")
[,1] [,2]
[1,] 2 3
[2,] 3 4
となることからヒントを得ると、次のようにすればよい。
> outer(as.vector(b),as.vector(c),"+")
[,1] [,2]
[1,] 2 3
[2,] 3 4



516 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/18(金) 18:05:46.17 ]
Rjpwikiに回答したくないので（スルー検定失格の烙印を押されたくないので）、こちらに書く。

> line <- '127.0.0.1 - frank [10/Oct/2000:13:55:36 -0700] "GET /apache_pb.gif HTTP/1.0" 200 2326 "htp://www.example.com/start.html" "Mozilla/4.08 [en] (Win98; I ;Nav)" '
> m <- gregexpr("(\\d|[01]?\\d\\d|2[0-4]\\d|25[0-5])\\.(\\d|[01]?\\d\\d|2[0-4]\\d|25[0-5])\\.(\\d|[1]?\\d\\d|2[0-4]\\d|25[0-5])\\.(\\d|[01]?\\d\\d|2[0-4]\\d|25[0-5]) ", line, perl=TRUE)
> regmatches(line, m)
[[1]]
[1] "127.0.0.1 "

正規表現が書けるという前提だけど、上に示すとおり格段に難しいわけではない。
従って「非常に面倒かどうか」に対する答えは「全く面倒ではありません。ほぼコピペの世界です。」だ。


517 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/19(土) 00:29:19.34 ]
>>514-515
ありがとうございます。>>515がまさに望んでいたものでした。
outer関数についてよく勉強します。

518 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/19(土) 08:44:41.03 ]
a1 <- c("a", "b", "d", "f")
a2 <- c("b", "a", "f", "c")
a3 <- c("z", "m", "f", "a")
cbind(a1,a2,a3)
それぞれの行で"a"がある回数を求め、
処理結果をベクター、この場合にはc(1,1,0,1)としてまとめるにはどうすればよいでしょうか

519 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/19(土) 09:22:50.09 ]
>>518
ヒントを差し上げるので自力で考えてください。

> length(grep("a",c("b", "c", "d", "f")))
[1] 0
> length(grep("a",c("a", "b", "d", "f")))
[1] 1
> length(grep("a",c("a", "a", "d", "f")))
[1] 2

行単位で処理を繰り返す関数はapply()


520 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/19(土) 15:06:19.07 ]
# apply()を使わない手を考えようとしたが無理だった。

a1 <- c("a","b","d","f")
a2 <- c("b","a","f","c")
a3 <- c("z","m","f","a")
dat <- cbind(a1,a2,a3)
dat
dat == "a"

margin.table(dat == "a", margin = 1)

apply(dat == "a", MARGIN = 1, FUN = sum)


521 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/19(土) 15:15:20.42 ]
>>520
おぉ、それなら、
> rowSums(dat == "a")
[1] 1 1 0 1
もうこれでよさそう。

もう少し大きなテーブルでやってみると、
> d <- cbind(sample(letters[1:5],100,replace=TRUE),sample(letters[1:5],100,replace=TRUE),sample(letters[1:5],100,replace=TRUE))
> rowSums(d == "a")
[1] 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2 0 1 0 2 0 0 1 2 0 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 3 1 1 2 0 1 1
[38] 0 2 0 2 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 2 0 2 0 0 1 0 0
[75] 0 0 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 2 0 1 0
大丈夫そうだ。

# ヒントだけのつもりだったのに。。。

522 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/19(土) 16:52:03.11 ]
>>521
その手があったか。

速度的には
rowSum()
が有利と思われる。

523 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/19(土) 20:49:13.27 ]
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524 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/19(土) 23:04:29.94 ]
>>519-522
みなさんありがとうございます。
applyとrowsum()の両方を使えるようにします。


525 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/20(日) 00:05:52.54 ]
>>524
rowSums() だった。大文字小文字を区別するので注意。

entertainment-lab.blogspot.jp/2011/12/rapplyrowsums.html?m=1




526 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/23(水) 06:06:44.69 ]
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528 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/24(木) 21:30:30.29 ]
すいません、ほんっとに初歩的な質問なんですが…
Wikiをざっと見ても行列Tipsを検索しても見当たらないので質問させてください

データフレームを数値行列に変換させるにはどうすればよいのでしょうか？
列成分をデータフレームから指定しても、as.matrixなどの変換をしても、
%*%の操作をすると数値行列にしてくださいと言われます

とりあえずデータフレームの数値を使って行列計算をしたいので、誰かサクッと教えていただけると助かりますm(_ _)
m

529 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/25(金) 01:12:42.02 ]
as.matrixの前後でstr()してみて。
多分factorになっていて数字ではないのではないかと思う。

530 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/25(金) 03:03:02.18 ]
そうでした
そしてこれを数字にするには…

531 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/25(金) 03:04:41.50 ]
as.characterしてas.numericで数値化されるかどうか

532 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/25(金) 09:13:25.21 ]
>>531
ヘルプには
To transform a factor ‘f’ to
approximately its original numeric values,
as.numeric(levels(f))[f]’ is recommended and slightly more
efficient than ‘as.numeric(as.character(f))’.
て書いてあるけどね。

533 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/25(金) 15:01:44.54 ]
>>532
そんなやり方があるのか、覚えられないなでも

534 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/25(金) 16:48:14.73 ]
>>533
今、確認してみたら、as.numeric()だけでも元に数字に戻るね。
> (a <- factor(sample(1:5, 10, replace = TRUE)))
[1] 2 3 1 1 1 1 1 5 2 2
Levels: 1 2 3 5
> as.numeric(a)
[1] 2 3 1 1 1 1 1 4 2 2
> as.numeric(levels(a))[a]
[1] 2 3 1 1 1 1 1 5 2 2
> as.numeric(as.character(a))
[1] 2 3 1 1 1 1 1 5 2 2

前からこうだったっけ？
いつの間にか仕様が変わった？


535 名前：532, 534 mailto:sage [2012/05/25(金) 16:50:52.24 ]
あっ、ごめん。たまたまsample()の出力がわかりにくかっただけみたいだ。
as.numeric()だと「5」のところが「4」になっているから、
as.numeric(factorクラス)はやっぱり駄目だ。



536 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/25(金) 16:54:11.34 ]
もっと顕著に分かるようにしてみた。スレ汚しすまん。
> (a <- factor(sample(1:100, 10)))
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26
Levels: 20 24 26 33 40 42 51 66 91 100
> as.numeric(a)
[1] 2 6 5 4 8 7 1 10 9 3
> as.numeric(as.character(a))
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26
> as.numeric(levels(a))[a]
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26


537 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/27(日) 07:33:26.16 ]
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538 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/05/27(日) 08:50:40.45 ]
>>536

ご丁寧にどうもです！
as.numericだと変な数字になるから悩んでたのですが、そういう方法もあったのですね
as.matrixだけでも計算できない場合でもこれでよさそうです

ありがとうございました

539 名前：１３２人目の素数さん [2012/05/29(火) 04:32:41.65 ]
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540 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/03(日) 20:40:13.33 ]
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541 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/03(日) 23:20:55.48 ]
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542 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/04(月) 00:09:13.82 ]
pattern <- c("ab","ef")
target <- c("abaa","abef","aefe","cafe")

のように、2個のベクトルがあるとき、
pattern の各要素が target の各要素に含まれるかどうかを検索したい。
for 文を使わずに済ます、何かいい方法ある？

例えば上の例では、
[1] "abaa" "abef" "aefe"
のように出力されたら OK です。

つまり、コマンドライン的なら
grep -f pattern target
のようなことを R を使ってやりたいわけです。


543 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/04(月) 01:07:52.08 ]
>>542
?grepで意味が分からないなら
もうsystem()でいいじゃん

544 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/04(月) 07:28:20.53 ]
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545 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/04(月) 09:11:46.10 ]
>>543
grep() は、pattern の vector 長が 2 以上の場合、最初の要素しか
使われないのです。その上、target 内の要素の位置をベクトルで返す仕様。
せめて、論理値をベクトルで返してくれたらね。

残念なことに R を動かす環境には grep コマンドがなく、
現在は unix 環境で前処理してるけど、面倒臭いなあと思って
良い方法がないか尋ねた次第です。




546 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/04(月) 09:16:32.70 ]
あ、grepl は、論理値ベクトルを返してくれるんだね。知らなかったわ。


547 名前：543 mailto:sage [2012/06/04(月) 09:31:57.61 ]
grep関数群のヘルプを読んだ上で質問していたのか。
なら、下記はどうだろう？
> target[unique(as.numeric(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))]
[1] "abaa" "abef" "aefe"

で、関数化すれば
> f542 <- function(x, y) {target[unique(as.numeric(sapply(1:length(x), function(i){grep(x[i], y)})))]}
> f542(pattern, target)
[1] "abaa" "abef" "aefe"
となる。

apply関数群もなしにすましたいという後出しは禁止。

548 名前：543 mailto:sage [2012/06/04(月) 09:38:53.74 ]
おぉ、凡ミス
誤
f542 <- function(x, y) {target[unique(as.numeric(sapply(1:length(x), function(i){grep(x[i], y)})))]}
正
f542 <- function(x, y) {y[unique(as.numeric(sapply(1:length(x), function(i){grep(x[i], y)})))]}

549 名前：542 [2012/06/04(月) 10:34:25.66 ]
>>548
なるほど。確かに目的の処理ができます。
どうもありがとう。
私の頭がforで、applyできていませんでした。


550 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/04(月) 12:34:01.89 ]
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551 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/04(月) 19:03:37.28 ]
頭の体操
> target[unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target))))]
[1] "abaa" "abef" "aefe"



552 名前：551 mailto:sage [2012/06/04(月) 19:07:14.04 ]
こっちのほうがいいかも
> unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target, value=TRUE))))
[1] "abaa" "abef" "aefe"



553 名前：542 mailto:sage [2012/06/04(月) 19:39:49.43 ]
>>552 は、target内の要素が相異なることが前提になりますね。

あとは、target内の要素の順序を保つようにならないものかな。


554 名前：542 mailto:sage [2012/06/04(月) 19:47:57.32 ]
まあ、ソートすればOKと。

pattern <- c("ab","ef"); target <- c("abaa","abef","aefe","cafe","abef")

target[sort(unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))]


555 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/04(月) 19:49:05.43 ]
>>551, 552
あぁ、そうだね。
わざわざ1:lenght(pattern)でやるより、簡潔にsapply(pattern, function(x) ...)でよかった。
ご指摘ありがとう。

> target <- apply(matrix(sample(letters[1:6], 4 * 10000, replace = TRUE), ncol = 4), 1, paste, collapse = '')
> pattern <- c("ab","ef")

> system.time(target[unique(unlist(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))])
ユーザ システム 経過
0.004 0.000 0.005
> system.time(unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target, value=TRUE)))))
ユーザ システム 経過
0.004 0.000 0.007

速度的にはあまり変わらないみたいだが。




556 名前：542 mailto:sage [2012/06/04(月) 21:20:11.29 ]
ミスがありました。>>553 は unlist しないと駄目でした。
target[sort(unique(unlist(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))]

あと、greplを使えないかなと思い、>>555 氏の方法でランダム生成した
サイズ 10000 の target に対し、
target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)]
を適用してみましたが、apply系の関数を2重に使うと、当たり前ですが
遅くなりますね。
> pattern <- c("ab","ef")
> target <- apply(matrix(sample(letters[1:6], 4 * 10000, replace = TRUE), ncol = 4), 1, paste, collapse = '')
> system.time(target[unique(unlist(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))])
user system elapsed
0.01 0.00 0.02
> system.time(target[sort(unique(unlist(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))])
user system elapsed
0.02 0.00 0.02
> system.time(target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)])
user system elapsed
0.05 0.00 0.05


557 名前：542 mailto:sage [2012/06/04(月) 21:46:39.76 ]
rowSums は apply(x,1,sum) のエイリアスだと思ってたら、
rowSums のほうが、だいぶ速いんだね。知らなかったよ。
> system.time(target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)])
user system elapsed
0.05 0.00 0.05
> system.time(target[as.logical(rowSums(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target))))])
user system elapsed
0.01 0.00 0.02


558 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/04(月) 21:52:36.36 ]
>>557
投稿しようとしたら書かれてた
rowSumsはCで書かれてるはず
lapplyも同様
sapplyはlapplyを呼んでいる
applyはRで書かれていて遅い

559 名前：542 mailto:sage [2012/06/04(月) 22:04:53.47 ]
>>558
へえ。applyは、なるべく避けた方が良さげですね。勉強になりました。


560 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/04(月) 23:15:00.88 ]
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561 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/05(火) 07:03:58.00 ]
R.exeのインストールされていないwindowsPCで、Ｒ言語で書かれた
プログラムを実行する手段はありますでしょうか。
（Fortranの実行ファイルみたいなイメージです）

562 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/05(火) 07:09:23.62 ]
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　 　 　 | 　　　　 ` -'＼　　　 　 　ｰ' 　人　　　　　　　　　　一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
　　　　|　　　　　　　 /(l 　　 　＿＿／　 ヽ、　　　　　　　　　　　良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
　　 　 |　　　　　　　（:::::`‐-､__ 　|::::`､ 　 　 ﾋﾆﾆヽ、　　　　　　　　　あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
　 　　|　　　　　　／ `‐-､::::::::::`‐-､::::＼　　 /,ﾆﾆ､＼　　　　　　　　　　　　それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら？
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563 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/05(火) 15:37:11.75 ]
SAS使用歴20年、R半年の者です。
RにはSASで言うところのマクロみたいな物はないでしょうか？

564 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/05(火) 20:30:53.61 ]
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565 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/05(火) 22:40:37.65 ]
R2.15.0でRODBCとXLConnectを同時に使用しようとすると名前空間エラーがでませんか？



566 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/06(水) 00:22:27.48 ]
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567 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/07(木) 09:54:47.13 ]
放置されて可哀想なので、私には答える能力がないけど、答えてみる。

>>561
?compiler::compile
このあたりを入り口に文献を読んでみて。
ところで、R.exeが入ってなくても、R.dllは入れてもいいの？
やりたいことを達成するには、Cなどで書いて、
R.dllが一緒にインストールされるソフトを作成する必要がある気がする。

>>563
SASはほとんど使った経験がないから、回答する資格がないけど、
R言語そのものがRのマクロとも言えます。
お手元のR入門書の「関数化」の項を読んでみてください。

>>565
異なる作者による同じ目的のパッケージだと、そのようなことは起こるかも知れません。
何千もある投稿パッケージの全てにおいて整合性がとれているわけではありません。
再現性が確認できたら、RODBCとXLConnectのメンテナに報告するとよいでしょう。

568 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/09(土) 23:34:52.27 ]
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569 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/10(日) 06:29:56.30 ]
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570 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/13(水) 20:54:59.86 ]
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571 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/18(月) 14:21:06.94 ]
Rjpwikiの「Rだけでデータクリーニング」。
真摯な回答をする人が何人もいて、偉いな。

572 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/22(金) 16:40:13.73 ]
荒らされていてここじゃ書きずらくないですか？
Rってプログラミング言語なのでプログラムスレッドに移住するそうですよ。
無理にとは言わないので出来たらお願いしますね。

統計解析R たぶんpart3くらい
toro.2ch.net/test/read.cgi/tech/1340339592/

573 名前：１３２人目の素数さん [2012/06/24(日) 14:58:20.27 ]
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574 名前：542 mailto:sage [2012/06/27(水) 21:28:07.95 ]
sqldf package が便利なことに気付いた。


575 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/27(水) 22:14:18.48 ]
OpenOffice Calcのファイル.odsから直接Rのデーターフレームに
読み込む方法はないかなあ。
cvsに変換して読み込んでいるけど、ちょっとだけメンドイ。



576 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/28(木) 13:28:01.62 ]
>>575
read.ods() from ROpenOffice
ttp://www.omegahat.org/ROpenOffice/

577 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/06/28(木) 16:25:13.46 ]
>>576
サンクス！
CRAN関連ばかり探していたから引っかからなかった訳だ。
ダウンロードして見たが、CRANじゃないのでインストール方法が判らん。
初心者なんでもうちょっと勉強してみる。




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