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↑キャッシュ検索、類似スレ動作を修正しました、ご迷惑をお掛けしました

【R言語】統計解析フリーソフトＲ 第４章【GNU R】

1 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2011/01/09(日) 17:31:49 ]
R は統計計算とグラフィックスのための言語・環境です。
統計計算で重宝するデータ型や、複数要素を処理する演算や関数、
解析結果を表示するグラフィックなど、多彩な機能を提供します。

●関連サイト
The R Project
www.r-project.org/
RjpWiki
www.okada.jp.org/RWiki/
リンク集
www.okada.jp.org/RWiki/?%A5%EA%A5%F3%A5%AF%BD%B8

369 名前：名無しさん mailto:sage [2012/01/30(月) 21:51:46.12 ID:???]
>>368
krigingでググると
web.sfc.keio.ac.jp/~maunz/wiki/index.php?%C2%E807%B2%F3%B1%E9%BD%AC%A5%DE%A5%CB%A5%E5%A5%A2%A5%EB
っていうのが見つかりました。
ちょっとやってみます。どもでした。


370 名前：名無しさん mailto:sage [2012/01/30(月) 23:07:03.68 ID:???]
フジテレビ式円グラフはどうやって作ればよいのでしょうか？
blog.livedoor.jp/dqnplus/archives/1692812.html


自分にはこんなのが精一杯でした．．．

library(ggplot2)

DF <- data.frame(age=c("10〜20代", "30代","40代","50代"), value=c(97,78,78,94))

ggplot(DF, aes(x=age, y=value, fill = age)) +
geom_bar(width = 1) +
scale_y_continuous(breaks = 0:100) +
coord_polar() +
labs(x = "", y = "") +
opts(legend.position = "none", axis.text.y = theme_blank(),axis.ticks = theme_blank())



371 名前：名無しさん mailto:sage [2012/01/30(月) 23:16:40.05 ID:???]
>>370
また奥村先生がアップをはじめそうなグラフが出てきたな。

372 名前：名無しさん mailto:sage [2012/01/31(火) 00:39:21.68 ID:???]
中心をずらすって言うのはグラフ的にあり得ないからグラフのパッケージでは無理だと思う。
できるとしたら地図関係のパッケージだろうね。

373 名前：名無しさん mailto:sage [2012/01/31(火) 10:47:16.46 ID:???]
>>369
こんな感じじゃないの
i <- (1:360)/360*2*pi
cntr <- c(0.1,0.3)
v <- c(94,78,78,97)
arc <- cut(1:360,c(0,round(cumsum(v)*360/sum(v)),Inf))

plot(cos(i),sin(i),type="n",asp=1,axes=FALSE,xlab="",ylab="")
l <- levels(arc)
cols <- c("deepskyblue","dodgerblue1","dodgerblue3","brown1")
lbs <- c("50代\n94人","40代\n78人","30代\n78人","10〜20代\n97人")
cexs <- c(1.5,1.5,1.5,3)
for (j in 1:4){
k <- c(i[arc==l[j]],max(i[arc==l[j]])+1/360*2*pi)
polygon(c(cntr[1],cos(k)),c(cntr[2],sin(k)),
col=cols[j])
text(mean(cos(k))/1.5,mean(sin(k))/1.5,lbs[j],cex=cexs[j])
}


374 名前：名無しさん mailto:sage [2012/01/31(火) 12:12:08.71 ID:???]
>>370
ウジのグラフは、センターがずれてるだけじゃなくて「弧の長さの割合」も意図的に変えてるから、完全再現は無理みたいよｗ
参考　blog.kzfmix.com/entry/1327735061

そもそも、あんなおぞましいグラフを好んで描く必要ないと思うけど、こんなんでどう?
library(grid)
quartz(height=4, width=4)
#png(filename = "fuji-pie.png", width = 360, height = 360, units = "px")
num <- c(94, 97, 78, 78)
distortion <- c(1, 1.2, 1, 1) # <- !!
dist_num <- num * distortion
cum <- c(0, cumsum(dist_num))
rad <- cum / sum(dist_num) * 360 / 180 * pi
colors <- c("#0000FFAA", "#FF0000AA", "#000055AA", "#0000AAAA")
labels <- paste(c("50ies¥n", "10~20ies¥n", "30ies¥n", "40ies¥n"), num, " ps", sep="")
lab_cex <- c(1, 1.5, 1, 1)
lab_col <- c("white", "yellow", "white", "white")
div <- 200 # 円弧部分の分割数
dx <- 0 # 半径=0.5 として、x 方向への中心のズレ (-0.1 とかにすると、より強烈ｗ)
dy <- 0.1 # 半径=0.5 として、y 方向への中心のズレ
for (i in 1:length(num)) {
x <- c(0.5 + dx, 0.5 + 0.5 * sin(rad[i]), 0.5 + 0.5 * sin(seq(rad[i], rad[i+1], length.out=div)), 0.5 + 0.5 * sin(rad[i+1]))
y <- c(0.5 + dy, 0.5 + 0.5 * cos(rad[i]), 0.5 + 0.5 * cos(seq(rad[i], rad[i+1], length.out=div)), 0.5 + 0.5 * cos(rad[i+1]))
grid.polygon(x=x, y=y, gp=gpar(fill=colors[i]))
grid.text(x=0.5 + 0.4 * sin((rad[i]+rad[i+1])/2), y=0.5 + 0.4 * cos((rad[i]+rad[i+1])/2), label=labels[i], gp=gpar(col=lab_col[i], cex=lab_cex[i]))
}
#dev.off()

RjpWikiにも置いときました。
www.okada.jp.org/RWiki/?R%20%A4%C7%A5%A8%A5%F3%A5%BF%A5%E1#nf026bb6


375 名前：名無しさん mailto:sage [2012/01/31(火) 12:41:24.02 ID:???]
>>373-374
すげー
これフジテレビに売り込みにいけよwww

376 名前：373 mailto:sage [2012/01/31(火) 14:45:06.35 ID:???]
私の方もRjpwikiに追加しておきました。

>>374さんは河童さんかと一瞬思ったけど、
そういえば河童さんはgridが嫌いだったから、別な人ですね。

377 名前：375 mailto:sage [2012/01/31(火) 23:04:16.60 ID:???]
もちろん、河童さんの足下にも及ばない半素人です

裏Wikiの方でも、がっつりとダメ出しされましたｗ
でも「裏」氏のファンなので、ちょっと嬉しかったりもしますｗ



378 名前：374 mailto:sage [2012/01/31(火) 23:16:34.60 ID:???]
↑で、名前間違えてた...orz

379 名前：名無しさん mailto:sage [2012/01/31(火) 23:52:13.20 ID:???]
まさに誰得関数！

380 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/02(木) 15:19:45.32 ]
知恵を貸してください。
0〜6ぐらいまでの整数を要素にもつサイズが50のベクトルを作りたい。
できればポアソン分布に従って。
ここまでなら、
> rpois(50,2.5)
[1] 1 1 1 4 4 3 0 3 3 3 0 1 1 0 4 5 2 2 2 2 4 0 4 4 2 1 3 1 1 3 3 2 1 1 3 4 3 3
[39] 3 3 4 1 1 1 5 5 1 0 3 6
こんな感じでできるんだけど、このベクトルの合計をきっちり150にしたい。
固定したいのは、ベクトルサイズ50とベクトル合計値150だけで、lambdaとかは適当でいい。

当たり前だけど、合計値は変動する。
> sum(rpois(50,2.5))
[1] 132
> sum(rpois(50,2.5))
[1] 131
> sum(rpois(50,2.5))
[1] 118

こういうときはどうすればいいんだろうか。
よろしくお願いします。

381 名前：１３２人目の素数さん [2012/02/02(木) 16:52:09.32 ]
>>380
無理やりの処理だが、こんなんじゃ駄目？

mypois <- function(n=50,sum=150,adjtimes=10){
myvec <- rep(0,times=n)
mysum <- 0
for(i in 1:adjtimes){
mysum <- sum(myvec)
myvec <- myvec + sign(sum-mysum)*rpois(n,abs(sum-mysum)/n)
myvec[myvec < 0] <- 0
if( abs(sum-mysum) == 0 ){ break }
}
return(myvec)
}

> x <- mypois(50,150)
> x
[1] 3 2 3 2 5 3 4 5 4 0 1 1 5 4 6 3 5 5 0 4 4 3 4 5 4 7 1 4 1 2 1 2 3 2 1 3 7 2
[39] 0 2 2 3 0 1 3 6 3 4 2 3
> sum(x)
[1] 150


382 名前：381 mailto:sage [2012/02/02(木) 17:00:53.33 ]
0から6になってなかったのと、計算の順番がおかしかったので修正した。

mypois <- function(n=50,sum=150,max=6,adjtimes=10){
myvec <- rep(0,times=n)
mysum <- 0
for(i in 1:adjtimes){
myvec <- myvec + sign(sum-mysum)*rpois(n,abs(sum-mysum)/n)
myvec[myvec < 0] <- 0
myvec[myvec > max] <- max
mysum <- sum(myvec)
if( abs(sum-mysum) == 0 ){ break }
}
return(myvec)
}

> x <- mypois(50,150,6)
> x
[1] 1 6 1 0 5 3 5 1 2 6 3 3 6 3 3 3 3 3 1 4 2 3 3 0 5 4 3 6 3 5 2 4 4 0 2 1 3 3
[39] 2 4 0 2 1 3 6 4 4 2 1 6
> sum(x)
[1] 150


383 名前：381 [2012/02/02(木) 17:33:39.03 ]
青木先生のところの poissondist に嵌めたら、今一つなのは、
0〜6からはみ出たデータを丸めたからかな。上手い方法がないものかねぇ。

> x <- mypois(50,150,6)
> x
[1] 5 2 1 3 4 4 3 4 3 0 5 5 3 3 1 2 4 4 4 2 5 0 3 4 2 2 3 4 4 1 6 1 1 5 4 4 2 4
[39] 2 5 1 3 2 0 5 2 5 4 1 3
> poissondist(hist(x,plot=F)$counts)

ポアソン分布への適合度の検定

data: hist(x, plot = F)$counts
X-squared = 9.7821, df = 4, p-value = 0.04426
sample estimates:
n lambda
50.00 2.06


384 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/02(木) 18:40:11.25 ]
>>381-383
おぉ、十分です。最大は「6ぐらい」なので７とかでもOKですから、
丸めはマイナスになるときだけ必要です。
for文のところはとても勉強になりました。
ありがとうございました。


385 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/06(月) 23:36:20.10 ]
こんばんはR初心者です。
一通り調べたのですが、分からない事があるので質問させてください。
○行ごとのplotを行いたい場合、どのようなコマンドを打てば良いのでしょうか？

例えば、
y1 y2...y10
x1
x2
.
.
.
x100
このような100行×10列のデータフレーム名Xの2列目と4列目をplotしたい場合、
plot(X$y2,X$y4)で1行ごとのplotは出来るのですが、
これをx1,x5,...x100と5行おきにplotしたいのです。

どうかご教授ください。


386 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/07(火) 00:25:49.86 ]
>>385
X1 <- X[(0:20)*5+2, ]

387 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/07(火) 08:46:05.39 ]
>>385
＞このような100行×10列のデータフレーム名Xの2列目と4列目をplotしたい場合、
＞plot(X$y2,X$y4)で1行ごとのplotは出来るのですが、
＞これをx1,x5,...x100と5行おきにplotしたいのです。

plot(X[seq(1, 100, 5), c(2, 4)])
でどう？

[行番号, 列番号]
で要素を指定

seq(from, to, by)で1,6,11.16...,100をつくる






388 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/07(火) 22:43:27.83 ]
>>385

1,5,...,100 は、最初だけ4行の間隔ですね。
5,10,15,...,100 、あるいは、1,6,11,...,96 ですか？

でしたら、私のお薦めも >>387 と同じ方法。


389 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/08(水) 13:38:50.77 ]
Emacs ESS でアンダースコアが" <- "になってしまうのが凄く迷惑なんだけど
なんであれがデフォルトなんだろう

390 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/08(水) 17:34:58.86 ]
タイプ量減るしいいじゃん。

391 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/08(水) 20:31:18.89 ]
>>389
アンダースコア2度打ちで、アンダースコアを入力できるというのを
知った上で迷惑と行っているのだろうね。

そもそもRではアンダースコアは使用禁止だったので、
空いているアンダースコアにその機能が割り当てられたという歴史的経緯がある。
デフォルトの理由は、>>390の言うとおり便利で楽だかから。
いやな人は設定を変更すればいいし。

逆にターミナルでRを使っていて、<-のつもりでアンダースコアを入力して
イラッと来ることがある。


392 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/08(水) 22:46:01.26 ]
>>391
設定変えるためにググってたらrjpに飛んで、そこで初めて二度打ちやC-q _ でアンダースコアを入力できることを知った

アンダースコアを打つためにわざわざテキストモードに変更してた

よく調べもしないで愚痴言ってすいません

393 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/13(月) 12:25:46.70 ]
emacs essでRコマンダー使うとRコマンダーで外部データを読み込ませた瞬間固まるorz
うまくいってるかたいますか？


394 名前：393 mailto:sage [2012/02/13(月) 14:44:06.36 ]
すいません自己解決？しました。

emacsのR側で一行でも改行がコマンドを実行すればコマンダー側のフリーズが直りました。

フリーズ自体は何台かのPCで試したところ起こる場合と起こらない場合がありました。
環境に依存するようです。


395 名前：１３２人目の素数さん [2012/02/13(月) 22:00:37.21 ]
>>393,394
emacs ess で Rコマンダーを使うメリットって、何？
利点がまったく分からないのだけど。


396 名前：393 mailto:sage [2012/02/14(火) 00:04:31.33 ]
>>395
ご指摘のとおりで。
研究仲間がコマンダー使ってて、両方同時に使えると便利だから試しました。
まぁそうじゃなくても使えないよりは使えたほうが少しくらい便利かなと、、、

397 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/15(水) 23:54:50.83 ]
Rにはschemeなんかのfoldにあたるような高階関数はないんですか?
せっかくベクトル演算言語なので数え上げも高階関数で出来ればと思ったんですが。



398 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/16(木) 09:49:58.30 ]
>>397
stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/base/html/funprog.html
プログラミング言語はよくわからないけど、これは参考になるだろうか？

399 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/16(木) 09:57:29.11 ]
>>398
たぶん Reduce()がfoldに相当するんじゃね

400 名前：397 mailto:sage [2012/02/16(木) 16:23:10.40 ]
>>398>>399
それです
ありがとうございます

401 名前：398 mailto:sage [2012/02/16(木) 16:52:41.50 ]
>>400
いまいちイメージがわかないんだけど、面白い使い方があったら、教えてくだされ

402 名前：１３２人目の素数さん [2012/02/17(金) 05:50:16.64 ]
lmによる回帰分析で、切片をあらかじめ固定することはできますか？
切片を取り除くには「-1」を指定するということはわかりますが、ここを好きな値に固定したいのですが・・・

403 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/17(金) 13:00:44.62 ]
>>402
ttp://r.789695.n4.nabble.com/R-Forcing-the-intercept-td812422.html


404 名前：397 mailto:sage [2012/02/17(金) 19:52:56.72 ]
>>401
おもしろいかどうかわかりませんが、
data <- as.integer(runif(10,1,21))
のようなデータがある時に、
predicate <- function(x) { x < 5 }
が真になるような項目を数え上げたいとします。

for文を使うと

ret <- 0
for(i in 1:length(data)){ if (predicate(data[i])) { ret <- ret + 1 } }

のような形になりますが、高階関数を使うと、

length(Filter(predicate, data))

と書けるようになります。
これは関数プログラミングの技法で、もう少し詳しく学びたいようでしたら
programming in haskellなんかが薄くていい本なんじゃないかと思います。

405 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/17(金) 20:15:30.11 ]
>>404
>>401じゃなくて申し訳ないが、
> length(Filter(predicate, data))
[1] 4
> sum(data<5)
[1] 4

この場合だと下の方が簡単。しかも、
> system.time(sapply(1:1000, function(x){length(Filter(predicate, data))}))
ユーザ システム 経過
0.072 0.000 0.074
> system.time(sapply(1:1000, function(x){sum(data<5)}))
ユーザ システム 経過
0.000 0.000 0.002
圧倒的に速い。

406 名前：405 mailto:sage [2012/02/17(金) 20:17:05.57 ]
s/下の方が/後者の方が/


407 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/17(金) 22:46:29.44 ]
>>404
「おぉ高階関数はこれほどまでに便利なものかと実感できる事例」を期待している。



408 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/18(土) 05:48:26.33 ]
rubyで高階関数組み合わせてやってたけど
Rに移ってtapplyとかmapplyが便利すぎて禿げた

409 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/18(土) 06:05:41.05 ]
>>404
Filter()の例は
length(data[data < 5])
みたいなもんか


410 名前：397 mailto:sage [2012/02/18(土) 11:40:22.15 ]
>>405
なるほど、そんな書き方が出来るんですか
だとしたらそちらの方がよさそうです
速度はおそらく最適化の問題でしょう
下の方がRネイティブっぽいので十分な最適化が行われているんだとおもいます

411 名前：397 mailto:sage [2012/02/18(土) 12:01:56.66 ]
>>407
事例はちょっと思いつかないんですが
高階関数はプログラムの中の構造を関数として再利用するためのものです

その点では>>404はあまりいい例ではなくて、
ret<-0
for(i in 1:length(data)){if(predicate(data[i])){ret<-ret+1}else{ret}}
について高階関数を利用する例だとすると、
Reduce(function(ret, x){if(predicate(x)){ret+1}else{ret}},data,0)
になります。これは外側のループの部分の構造をReduceという関数で再利用していると言う形になります

でもどうやらこの手の単純な高階関数はベクトル計算という形でRに組み込まれているようなので
あまり出番はなさそうですね

412 名前：１３２人目の素数さん [2012/02/19(日) 03:55:37.05 ]
　　　　　　　　　　__ﾉ)-'´￣￣`ｰ- ､_
　　　　　　　 ,　'´　　_. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
　　　　　　／　　 ／:::::; -‐''"　　　　　 　 `ｰノ
　　　　　/　　　／:::::／　　　　　　　　　　　＼
　　　　 /　 　 /::::::/　　　　　　　　　 |　|　|　 |
　　　　 |　　　|:::::/　/　　　　　|　　|　|　|　|　 |
　 　 　 |　　　|::/　/　/　|　　| ||　 |　| ,ﾊ .| ,ﾊ|
　 　 　 |　　　|/　/　/　/|　,ﾊﾉ|　/|ﾉﾚ,ﾆ|ﾙ'　
　　　　 |　　　|　 |　/　/ ﾚ',二､ﾚ′ ,ｨｲ|ﾞ/　　　私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
.　　　 　|　　　＼ ∠イ　 ,ｲイ|　　　 ,`-' |　　　　　　頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
　　　　 | 　　　　l＾,人| 　` `-' 　 　 ゝ　 |　　　　　　　　さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
　 　 　 | 　　　　 ` -'＼　　　 　 　ｰ' 　人　　　　　　　　　　一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
　　　　|　　　　　　　 /(l 　　 　＿＿／　 ヽ、　　　　　　　　　　　良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
　　 　 |　　　　　　　（:::::`‐-､__ 　|::::`､ 　 　 ﾋﾆﾆヽ、　　　　　　　　　あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
　 　　|　　　　　　／ `‐-､::::::::::`‐-､::::＼　　 /,ﾆﾆ､＼　　　　　　　　　　　　それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら？
　　　|　　　　　　|::::::::::::::::::|` -､:::::::,ﾍ￣|'､　 ﾋﾆ二、　＼
.　　 |　　　　　　/::::::::::::::::::|::::::::＼/:::Ｏ`､::＼ 　 |　'､　　 ＼
　　 |　　　　　 /:::::::::::::::::::/:::::::::::::::::::::::::::::'､::::＼ﾉ　　ヽ、　 |
　　|　　　　　 |:::::／:::::::::/:::::::::::::::::::::::::::::::::::'､',::::'､ 　/:＼__/‐､
　　|　　　　　 |／:::::::::::/::::::::::::::::::::::::::::::::::Ｏ::| '､::|　く:::::::::::::￣|
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413 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/19(日) 08:58:51.23 ]
教えてください。
Epiパッケージを使用して、ROC曲線下面積を求めたら0.5未満になりました。
独立変数は二分変数に関係しないと判断しその値(0.425)を記載することは正しいのでしょうか?



414 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/19(日) 17:00:59.94 ]
アウトカムの変数は予測因子の数字が大きくなると大きくなると陽性になりますか？もし数が大きい方がアウトカムが陰性ならば、アウトカムの1,0をひっくり返す必要があるかも？

415 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/02/19(日) 23:14:01.45 ]
>>414
ありがとうございます。
明日にでも、いれかえて検討してみます。

416 名前：１３２人目の素数さん [2012/02/29(水) 23:39:27.42 ]
応答曲面法で最適値を求めるっていうのは出来ないのか？
パッケージrsmがそれっぽいんだが


417 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/01(木) 23:08:27.13 ]
>>416
なんていうか、もろに、rsm()　がそうなんだが？
使い方は
www.jstatsoft.org/v32/i07/paper
をみてくれ




418 名前：１３２人目の素数さん [2012/03/03(土) 12:45:30.73 ]
Rを2.14.2にしたいんですが、インストールして再起動すると確かに2.14.2にはなるんですが、保存していたオブジェクトが全て消えてしまいます
オブジェクトを引き継ぐ方法はないんでしょうか？
今は2.13.1を使ってます

419 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/03(土) 16:40:03.10 ]
save(list = ls(all=TRUE), file = "old.RData")
で明示的に保存ファイルを作って、
それを新バージョンで
load(file = "old.RData")
したらどうなる？



420 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/04(日) 18:26:31.31 ]
マルチコア対応しましたか〜？？

421 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/04(日) 19:53:40.43 ]
parallelというパッケージができたね

422 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/04(日) 20:21:12.91 ]
>>420
ググると、gotoBLASをマルチコア向けにコンパイルしてRで利用する話が、
詳しく解説されている。

調子に乗ってcuBLASに差し替えられないかと考え、
プログラム板のcudaスレに行ったことがあるが、
あそこの住人はnvccを使わない人間をバカだと考えているみたいだ。

423 名前：420 mailto:sage [2012/03/04(日) 22:56:21.28 ]
>>421 >>422
良い情報をありがとうございます。
調べてみます。

シングルスレッド性能でのCPU探しも終わりにしたいですw

424 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/04(日) 23:06:08.66 ]
今なら分散処理じゃ無いかな。IT系のWebサイトじゃあ hadoop とか流行ってるし、
解きたい課題を Map-Reduce に落とし込めればRでの分散処理も可能かと。

425 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/08(木) 19:59:09.03 ]
ttp://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/
preciseはまだまだ来ないね。

426 名前：１３２人目の素数さん [2012/03/11(日) 23:35:42.80 ]
R初心者でpolr関数を使って解析しているのですが、
P値の出し方がわかりません。

お分かりになる方いらっしゃいましたら教えて頂けないでしょうか。

詳細な情報が必要であれば補足します。

427 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/12(月) 16:16:16.41 ]
stats.stackexchange.com/questions/7720/how-to-understand-output-from-rs-polr-function-ordered-logistic-regression
の二番目の最後のところをみると、正確にはもとまらないから、計算されないようになっている、ということのように思いました。



428 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/13(火) 00:08:39.50 ]
www.r-project.org/
R 2.15.0 prerelease versions are currently available. Final release is scheduled for March 30.

429 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/15(木) 07:30:22.52 ]
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430 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/20(火) 20:20:19.86 ]
Rを使ってる最中(emacs+ess)
作ったオブジェクトの数が多くなって、ls()で変数名を見ても、
思い出せない。

こういう状況に対処するにはどうしたら良い？
新しい環境を用意して、そちらに移す？(assignを使って、.GlobalEnvのものを消す?)
それとも、特定のファイルに保存する？（複数個のオブジェクトを１ファイルに保存できる？)

よい方法などがあれば、教えて。

あと、
emacs+essを使ってるけど、lispとかは分からんので、
emacsの機能での解決方法を示されても反応できないかも。
その時は、ごめんなさい。

431 名前：430 mailto:sage [2012/03/20(火) 20:22:30.66 ]
言葉不足だったので、訂正します。
>>assignを使って、.GlobalEnvのものを消す?
assignを使って別の環境にデータを入れて、.GlobalEnvの方は消す?

432 名前：430 mailto:sage [2012/03/20(火) 20:28:40.90 ]
>>419
でファイルに保存する方法があったね。見てなかった。

save(list=c("オブジェクト名1","オブジェクト名2"),file="a_path")
とかでもいいのか。でも、なんか面倒だな。

433 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/20(火) 21:37:25.25 ]
>>430
変数名を見ても思い出せない命名法に問題がありそうだけど
あと俺は使っていないけどcomment()を上手に使うとか。

434 名前：430 mailto:sage [2012/03/21(水) 00:50:48.76 ]
>>433
こんな感じ？
tmp <- sapply(ls(), function(x)comment(eval(parse(text=x))))
tmp[sapply(tmp,is.null)] <- NULL
tmp
これを関数にしておいて、呼び出せば良いかな？

あとは、commentに自動的に参照or作成時間を入れておくとかかな。
どうやったらできるか分からないけど。

435 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/22(木) 22:37:07.40 ]
スクリプトをファイルに書き出して基本的にはバッチモードでRを動作させております。
その場合のエラーハンドリングってどうしてますか?
stop関数で停止はするのですが、
どの関数のどの行数で停止したかなどがいまいちわかりづらいときがあります。
引数で与えるコメントを変えればいいのでしょうが、いちいち面倒なので。。。

例えばCだと
printf("%s %s\n", __FILE__, __LINE__);
なんかで対応できるんですが。。

いい方法ありますか?

436 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/26(月) 13:16:29.99 ]
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437 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/26(月) 17:52:13.93 ]
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438 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/27(火) 00:36:36.55 ]
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439 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/27(火) 12:48:45.92 ]
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440 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/27(火) 20:00:22.88 ]
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441 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/27(火) 23:36:28.28 ]
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442 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/29(木) 01:36:02.65 ]
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443 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/03/30(金) 22:40:29.56 ]
R 2.15.0 is released
www.r-bloggers.com/r-2-15-0-is-released/


444 名前：１３２人目の素数さん [2012/04/03(火) 21:15:56.45 ]
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445 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/06(金) 18:58:58.10 ]
チラ裏
Meadow 2.10(Emacs 21.4.1) + R 2.15.0 で、
ESS 5.14 → ESS 12.04 にしてみたら、
symbol's function definition is void と言われてしまい、
元に戻した今日の夕暮れ。


446 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/10(火) 15:45:27.97 ]
ttp://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/
Preciseはまだ来ないね。4月26日以降になるのかな

447 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/14(土) 11:43:41.70 ]
R2.15.0　って、なんか目玉機能あります？




448 名前：１３２人目の素数さん [2012/04/20(金) 23:36:06.27 ]
ソースコードが１つのファイルで２万行ぐらいになってしまったので
複数のファイルに分割したいのですがやり方がわかりません。
助けてください

449 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/20(金) 23:38:20.91 ]
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.　　　 　|　　　＼ ∠イ　 ,ｲイ|　　　 ,`-' |　　　　　　頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
　　　　 | 　　　　l＾,人| 　` `-' 　 　 ゝ　 |　　　　　　　　さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
　 　 　 | 　　　　 ` -'＼　　　 　 　ｰ' 　人　　　　　　　　　　一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
　　　　|　　　　　　　 /(l 　　 　＿＿／　 ヽ、　　　　　　　　　　　良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
　　 　 |　　　　　　　（:::::`‐-､__ 　|::::`､ 　 　 ﾋﾆﾆヽ、　　　　　　　　　あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
　 　　|　　　　　　／ `‐-､::::::::::`‐-､::::＼　　 /,ﾆﾆ､＼　　　　　　　　　　　　それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら？
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450 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/21(土) 07:52:14.18 ]
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451 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/21(土) 09:49:45.56 ]
>>448
2万行って何それ、すごい。
そんなにRの専門家なのに、そんなことを悩むとはw
source()を使って階層的にしたら駄目なの？

452 名前：１３２人目の素数さん [2012/04/21(土) 16:42:07.10 ]
>>448
むしろ、何の処理をさせたら、2万行になるのか知りたい。


453 名前：１３２人目の素数さん [2012/04/21(土) 17:49:35.34 ]
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454 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/21(土) 18:59:03.29 ]
>>448
縦書きか

455 名前：１３２人目の素数さん [2012/04/24(火) 07:20:26.82 ]
SUBSTR<- function(X,S,E){
if(length(unique(nchar(X)))>1)stop("warning")
if(unique(nchar(X))<max(S,E)|min(S,E)<=0)stop("warning")
temp<-t(sapply(X,function(X){mapply(substr,X,start=S,stop=E)}))
dimnames(temp)<-NULL
temp
}


456 名前：１３２人目の素数さん [2012/04/24(火) 07:25:35.41 ]
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　　　　 | 　　　　l＾,人| 　` `-' 　 　 ゝ　 |　　　　　　　　さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
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457 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/24(火) 10:40:39.43 ]
>>455
突然どうしたの？

オレならecho X | cut -cS-Eをsystem()でやっちゃうな。



458 名前：１３２人目の素数さん [2012/04/24(火) 12:16:39.44 ]
barplotの質問です　cran.md.tsukuba.ac.jp/bin/windows/base/ を使っています。
100個の文字列(labels)と数値(num)を棒グラフに書き出したいのですが
barplot(num, names.arg=labels)
いざ書き出すと文字列名がすべて表示されません
理想的にはcommons.wikimedia.org/wiki/File:English_letter_frequency_(alphabetic).svg
このように数値と文字列をすべて表示させたいのですが、どうすればよいでしょうか。

また、numでソートした棒グラフとlabelsでソートした棒グラフをそれぞれ作成するには
どうすればいいでしょうか。
他のプログラミングでいうとろこの、
ハッシュ構造に文字列と数値を格納してキーと値でそれぞれソートするという手順がよく分かりません。

459 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/24(火) 12:32:11.32 ]
>>458
グラフのサイズを多きすくすれば細かい文字も入るよ。
> pdf(file="test.pdf",width=50,height=10)
> barplot(round(runif(100),1),names.arg=sapply(1:100,function(x){sample(LETTERS,1)}))
> dev.off()
ソートは次の例を参考にしてくれ。
> (a <- data.frame(v=round(rnorm(5),1),n=sample(LETTERS,5)))
v n
1 -0.1 F
2 -0.4 W
3 1.6 M
4 -0.2 R
5 -0.5 V
> a[order(a$v),]
v n
5 -0.5 V
2 -0.4 W
4 -0.2 R
1 -0.1 F
3 1.6 M
> a[order(a$n),]
v n
1 -0.1 F
3 1.6 M
4 -0.2 R
5 -0.5 V
2 -0.4 W

460 名前：459 mailto:sage [2012/04/24(火) 12:37:45.20 ]
>>459の
barplot()は
> barplot(round(runif(100),1),names.arg=sample(LETTERS,100,replace=TRUE))
に差し替え。最初はアルファベット2文字で書こうとしたのでsapply()が入った。


461 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/24(火) 22:47:48.17 ]
　　　　　　　　　　__ﾉ)-'´￣￣`ｰ- ､_
　　　　　　　 ,　'´　　_. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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　　　　 | 　　　　l＾,人| 　` `-' 　 　 ゝ　 |　　　　　　　　さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
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462 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/24(火) 23:01:21.57 ]
>>459-460
ありがとうございます。ばっちりできました。

463 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/24(火) 23:52:37.90 ]
www.is.titech.ac.jp/~mase/R.html
R の公式マニュアル5種類の和訳

このサイトが見れないです

464 名前：459 mailto:sage [2012/04/25(水) 00:40:38.22 ]
>>463
10年以上前の情報だぞ。
書店で最新の本を買えよ

465 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/25(水) 00:59:05.13 ]
>>464
他にマニュアルの和訳したサイトってないんですか？

466 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/25(水) 14:04:32.25 ]
>>465
私の知る限りない。
現状では、マニュアルを読む気概がある人=英語でも大丈夫、という空気になっていて、
初心者や英語が苦手な人は、マニュアルを咀嚼した和書を購入すると思う。

467 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/25(水) 21:29:19.12 ]
>>466
ありがとうございます



468 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/27(金) 03:23:30.97 ]
sample(c("T", "F"), 1000, replace = TRUE)
こうして作成したベルトルからTの個数を数えあげるには
どうすればよいでしょうか
for(i in 1:1000){}として一つ一つ値を見るしかないのでしょうか。

469 名前：１３２人目の素数さん mailto:sage [2012/04/27(金) 06:14:45.59 ]
>>468
sum(sample(c("T", "F"), 1000, replace = TRUE))




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