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Macで学術系ソフト研究室のMac・4



1 名前:名称未設定 [2006/01/09(月) 03:44:50 ID:ak7LWmqO0]
大学や研究室で活躍するMacについて語るスレ。

過去スレ
【大学】学術用途でMacを使う【研究】
pc7.2ch.net/test/read.cgi/mac/1106402933/
Macで学術系ソフト&研究室のMac・2
pc7.2ch.net/test/read.cgi/mac/1018789103/
Macで学術系ソフト&研究室のMac
pc.2ch.net/test/read.cgi/mac/999450983/

152 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/08/12(土) 22:40:43 ID:VA2o1pho0]
>>151
コンテクストメニューから「このアプリケーションで開く」
を選んで、「常にこのアプリケーションで開く」のチェック
ボックスをチェックしてもダメ?

153 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/08/13(日) 08:25:48 ID:5qKDYgHw0]
>>151
MATLABは使ったことないが、
hoge.mという空のファイルを作って、
「情報を見る」からテキストエディットに関連づけできたぞ?
PBG4 + 10.4.7

>Get Infoダイアログ
「情報を見る」のこと?

>MATLABは選択できない
選択時に、「全アプリケーション」を選ぶ。
「推奨アプリケーション」では駄目。

154 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/08/13(日) 11:38:10 ID:axwV+b1g0]
>>152,153
.mも.matもTextEdit.appやたいていの普通のアプリケーション
には関連付けできるけど、MATLAB7.1に関連付けるのが
うまくいかないんです。
.mはXcodeに・・・というのはそれが理由でできないと言う
意味ではなかったです。まぎらわしくてすまんです。

Get Info(情報を見る)でも、コンテクストメニューから
「常にこのアプリケーションで開く」のもダメ。

>>MATLABは選択できない
>選択時に、「全アプリケーション」を選ぶ。
>「推奨アプリケーション」では駄目。
これもやったけどやっぱりダメです。
調べてみるとMATLABのUI部分はJavaらしいんだけど、
UNIX用とコードが共有されているためか
いろいろMacらしくないところがあって、
そもそも.mをドラッグアンドドロップで
MATLABの実体のファイルに持っていっても
開けない。そのファイルは通常のアプリケーションではなく
Unix Executable File。
こういう場合はやっぱり無理なのかな。



155 名前:153 mailto:sage [2006/08/13(日) 12:22:59 ID:5qKDYgHw0]
>>154
ああ、エディタってMATLABのエディタか。
無知で失礼。

名前が実際にどうなってるか分からないけど、
Terminalから
$ mkdir MATLAB_test.app
$ cp /Applications/MATLAB MATLAB_test.app
$ open ./MATLAB_test.app
ってやって走る?
.appの拡張子のdirectoryの中にUNIX exeを突っ込んでやれば、
ちゃんと認識してくれるかもしれない。
UNIX exeはアプリじゃなくて書類として扱われてしまう。


156 名前:153 mailto:sage [2006/08/13(日) 12:23:58 ID:5qKDYgHw0]
で、関連付けのときに、
MATLABじゃなくてさっき作ったMATLAB_test.appを選ぶとどう?

157 名前:153 mailto:sage [2006/08/13(日) 12:29:08 ID:5qKDYgHw0]
何度も失礼。
これだけじゃdrag & dropには対応しないや、多分。
.appの中に、いくつか適切なfileを用意すれば走るようになると思われ。
# 自分はOS X用のアプリ作ったことないので知らない。
他のXスレで質問すれば誰か教えてくれると思う。

158 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/08/13(日) 21:49:57 ID:axwV+b1g0]
>>155-157
ヒントサンクス。
なるほど。
なんかラッパーになるような.appフォルダを
作ってやる感じかな?
それできたら素晴しいな。ちょっと調べてみます。


159 名前:153 mailto:sage [2006/08/14(月) 07:13:59 ID:gsSZtpGa0]
ttp://hea-www.harvard.edu/RD/ds9/
例えばこれなんかだと、.appでラッパーになってる。
FITSという画像形式のviewer。

160 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/08/14(月) 10:07:26 ID:wCdzJqcj0]
MATLAB持ってないから知らないがInfo.plistいじればいいんじゃないの?



161 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/08/24(木) 11:25:00 ID:Wjp0BcNO0]
HyperChem Macを買ってみた。
(PowerBook G4 867MHz/768MB Mem/80GB HD)

・動作はかなり軽快、サンプルpdbファイルのタンパク分子もグリグリ動く。
・計算速度はそこそこ。3-アセチルチオフェンのB3LYP/3-21G*の一点計算が1時間程度、使用メモリが7-10MBぐらい
・バグが結構ある。つうか英語環境にしないとまともに動かない。
・6-31G基底がZnまでしか使えないため、Brを含む化合物などは3-21G基底等を使う必要がある。
・サポートが不安。バグが多いのにアップデータが出された形跡はなく、
Intel対応版もまだでていないみたい。

結論を言うと、ちょっとした計算や学習用途なら何とか使える(チュートリアルもMM,MD,MC,HF,DFT一通りそろっている)。
でも本格的な計算をしたいなら、奮発してGaussianかSpartanを買った方がいいと思う。

162 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/08/26(土) 03:22:03 ID:JOsDGW6j0]
>>161
>6-31G基底がZnまでしか使えないため、Brを含む化合物などは3-21G基底等を使う必要がある。
これは HypreChem だからっていうことじゃないだろ。

163 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/09/04(月) 01:16:57 ID:J3xPAQdM0]
SPARTANは知らないが、GaussianはKrまで6-31G基底が使えるようだ。
www.gaussian.com/g_ur/m_basis_sets.htm
(ってhpcがHPリニューアルしたから、日本語オンラインマニュアルが落ちてるね)


164 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/09/04(月) 20:16:04 ID:hZKLPucU0]
みんな、C++で巨大数の演算とか任意桁の浮動小数点演算とかするとき、
どのライブラリーを使ってるの?周りに数値計算やってる人がいないから、
ふと、気になって。

165 名前:名称未設定 mailto:age [2006/09/11(月) 08:15:07 ID:Prx1wjjf0]
保守

>>164
G5とかが必須とかじゃなけりゃ、
プログラム板でいいんじゃないの?
Macでしか走らないlibraryってあるの?

166 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/09/12(火) 07:20:13 ID:aUIXejGf0]
>>165
NTLはG4/G5では問題なく使えたのに、Intel Macではうまく使えなかったのさ。
まぁ、ここで返事がなかったら、別の板で聞くだけなんだけどさ。

167 名前:名称未設定 [2006/09/29(金) 12:06:32 ID:friY1Jgz0]
ImageJを作ってる、媒汚アーツとかいう会社って知ってる?この会社って
ちゃんとした会社なのかなあ?みんなの情報を教えてください。


168 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/09/29(金) 12:38:33 ID:7sHCH/fe0]
前にもどこかで話題になったと思うけど。
作ってるっていうよりローカライズして販売してるだけでしょ。

169 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/09/29(金) 12:42:44 ID:XSgA1cOp0]
ウェブに載ってる以上のことを
なにか知りたい理由があるの?
ttp://bioarts.co.jp/


170 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/09/29(金) 18:15:31 ID:Mx8UaiDb0]
このスレ話題は乏しいけど、
レスがつくのは早いんだなw



171 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/09/30(土) 10:36:02 ID:9wVyCkEY0]
>>167 imagejを使うような仕事をしているのなら、
ローカライズを通さないで使う事が期待されている。

172 名前:名称未設定 [2006/09/30(土) 12:16:21 ID:MS9z4By10]
九州で珍しい事やってるみたいだけど。仕事依頼するならどうかなあって思ってね
従業員とか資金力とか技術面とか評判を知りたくてね。
なんか怪しそうな気がしてるけど。

173 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/09/30(土) 13:03:19 ID:8MeLloD/0]
会社情報には従業員数はないね。一人か多くて数人でやってるんじゃないの?
しかし、技術顧問の山本とやらの方が怪しい気がする。

174 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/01(日) 12:21:29 ID:+K1h4VaG0]
>172,173
なにを見て怪しいと思ったかも書かないで
怪しいとだけ書いたんじゃ、お前らの方がよっぽどあやしい。

だいたい怪しいと思うなら同じようなことができる会社なんて
探せばいくらでもあるだろうに。
わざわざ「怪しい」ってここに書きに来てるように
見えるぞお前ら。


175 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/01(日) 18:33:45 ID:BST7yGOM0]
じゃ、信用出来るのか?
お前が保証出来るのか?

176 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/02(月) 01:34:20 ID:tz2DGYjz0]
信用できるなんて書いてないし
なんで俺が保証しないといけないんだよ。

だいたい俺が保証しないことと
「根拠なくあやしいって書いてるお前らがあやしい」ことに
どういう論理的な関係があるんだよ。

研究してる人間が来るようなこんなスレにも
アホっているんだな。


177 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/02(月) 07:27:00 ID:E3n3TaYk0]
関係者なんじゃないの?
本人かもw

178 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/02(月) 07:47:52 ID:90+E4pwC0]
>>176
お前が批判してる172,173と何一つ違いはないな。
そして苦しくなるとアホ呼ばわりか?自分を棚に上げて良く言うよ。

179 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/02(月) 09:55:08 ID:tz2DGYjz0]
>>178
論理的な違いの理解もできない人間に何言われても
何にも感じないです。


180 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/02(月) 09:58:28 ID:ZQKy0cSc0]
スレ違いなのは分かるが..Cisco VPN client=糞。なんで、core duoで動くのに
core 2 duoでカーネルパニック起こしやがるんだ。こいつがないと、そもそも
ネットにつなげないほどの、旗艦ソフトのくせしやがって。



181 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/02(月) 22:01:54 ID:90+E4pwC0]
>>179
つまりバイオアーツは怪しい会社だということだね。
君のおかげでそのことが良くわかったよ。

182 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/03(火) 00:43:13 ID:RjePPIqg0]
>>181
ひどいなこりゃ。
結局最後まで根拠も言わずあやしいって叫んでるだけかよ。

なんか嫌な目にあって仕返しでもしてるんならそれをさらしちゃえば?
がんばって悪いうわさ流そうとしても根拠が全く書いてないから
逆効果だよ。お前が書けば書くほどまともな会社に見えてくる。



183 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/03(火) 03:04:18 ID:ikhJNmt/0]
88-120でも論争になってたが、
なんで日本語ローカライズ会社でこんなに粘着するんだろ。

184 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/03(火) 06:52:49 ID:PvOlc2j70]
>>182
>お前が書けば書くほどまともな会社に見えてくる。

どっちかというと君が書けば書くほどあやしく見えてくる不思議w

185 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/03(火) 07:41:33 ID:p0wBO35q0]
>>182
そもそも下らんと思うなら無視すればそれで終わったのに、必死になって
擁護しようとするから逆に怪しまれるんだよ。

186 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/03(火) 08:36:54 ID:d0eH2ePh0]
なんだこの流れ。
俺にはその会社を擁護するメリットなんて全くないが
>>172,173,175,176,179,181
これはひどい。商売がたきの業者か?



187 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/03(火) 21:26:06 ID:B5RtEWu60]
imageJのソースコードが公開されているのだから、「商売敵」って・・・?
個人的にその会社が嫌いなのでしょうかねぇ?


188 名前:名称未設定 [2006/10/05(木) 00:23:25 ID:hYmtCbLL0]
会社名 株式会社Bio・Arts
所在地 〒812-0004
福岡市博多区榎田1丁目9−1<−−−−−実態あるのかなあ?
TEL : 092-474-3105 FAX : 092-432-1296<−−−−−一応コールする。
設立 2004年3月24日
資本金 1,000万円
代表取締役 上村 逸郎<−−−−−怪しいNo.1
臨床ソフト開発兼技術顧問 山本 修司 <−−−−−怪しいNo.2


189 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/05(木) 06:37:30 ID:OIpsQpgI0]
あーあって感じだなこりゃ・・。たしかに個人的っぽい。
仲間でたちあげた会社から途中でのけものにされたとかかね。


190 名前:名称未設定 [2006/10/05(木) 10:15:15 ID:Ad6tj4vN0]
見苦しいね!
根拠のない批判の連続・・・・
無知を公言してるようなものですね。



191 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/05(木) 11:03:16 ID:cLEZJdYx0]
maps.google.com/maps?client=safari&q=%E7%A6%8F%E5%B2%A1%E5%B8%82%E5%8D%9A%E5%A4%9A%E5%8C%BA%E6%A6%8E%E7%94%B0%EF%BC%91%E4%B8%81%E7%9B%AE%EF%BC%99%E2%88%92%EF%BC%91&ie=UTF8&oe=UTF-8&z=16&t=k&om=1

ここうるさくて仕事できないだろww

192 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/05(木) 12:59:05 ID:3Uh6ISPu0]
なんとしても怪しいってことにしたいみたいね。
その会社はどうでもいいがこのストーカみたいに粘着してるやつが
いったいどんな目にあったのか興味わいてくるわ。

>191
MAPで見れば普通にそのあたりに人が住んでるマンションも店舗も
コンビニもあるのが分かるのにわざわざサテライトにしてご苦労なことで。


193 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/05(木) 21:15:30 ID:Ta+sW0Mh0]
何だかんだ言いながらバイオアーツ批判が出ると必ず反撃しようとする奴が
いるな。関係者としか思えないが。普通はスルーすれば終わる話なのに
なぜか反撃せずにはいられないらしい。

194 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 02:05:14 ID:4dj3jOhn0]
ちゃんと理由のある批判は問題ないんだが
これって中傷だろ。何も理由書かずにあやしいの連発。

反撃してる方はその会社を擁護してるんじゃなくて
理由なく中傷するという行為を批判してる。
それを読んで「関係者としか思えない」って思う感覚は疑問。


195 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 06:38:47 ID:UwQ7a8pd0]
だってここ、2chだよ?

ムキになればなるほど粘着されるのに気付けよ。

196 名前:名称未設定 [2006/10/06(金) 08:55:54 ID:+C6NU3a10]
バイオアーツって会社、技術力もありそうで、先進的な事をやってる
みたいじゃん。
なんで批判されてるのか理解不能だね。
見る目無いんじゃないの?
ベンチャーで頑張ってる連中を応援しようなんて連中はいないのかね!
ここには。
バカというか寂しいね。

197 名前:名称未設定 [2006/10/06(金) 11:35:11 ID:dBxRLsEaO]
居るかよwww
荒らしより粘着な真性荒らしなら居るようだがw

198 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 12:16:31 ID:GHicNWro0]
2chはクズな発言もたくさんあるが、
ちゃんと考えてるやつの意見もあり
数によってバランスがとれてるから機能してるんだと思うんだ。

どうでもいいようなことなら俺もスルーするが
根拠もなく誰かをおとしいれようというような発言は
俺はスルーできないな。バランスのために必要だと思うからつっこむ。
悪意のあるコメントを書いたもん得になるんじゃバランスがとれてない。

逆に>196みたいなのも何を根拠にその会社をほめてるのかわからん。
どこを見て技術力がありそうで先進的と思ったのか書かないと
理由なくあやしいって言ってるやつと一緒。


199 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 16:34:24 ID:BL3UNLiC0]
 
 
 
 
    お前ら、これだけ長々とやりあうのは、そろそろスレ違いだと思わんか?


    お前らの自浄作用に期待したいぞ。
 
 
 
  

200 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 17:39:23 ID:UwQ7a8pd0]
しかしあまり話題もないようだし、
粘着キチガイ釣り師と擁護に必死な関係者との対決を眺めるのもまた一興。




201 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 19:39:40 ID:rSdjpRyz0]
ねぇねぇ、識者のおまえら
MathematicaってまだIntelで64bitに対応しとらんの?
G5だと64bitって書いてあるんだが...

202 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 20:35:44 ID:Ry7GZA+k0]
いつの間にかインテルコンパイラ出てたんだね
次から計算機はMac Pro買うように勧めよう

203 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 22:24:24 ID:jSAhCiZt0]
>>194
怪しいと書くことは中傷でも何でもないけど?詐欺だとかインチキ会社だとか
ありもしないことを書いたのなら中傷だが、怪しいというのは個人的な感想だろ?

お前こそ善意の第三者を装った関係者じゃないのか?怪しいなんて書いたくらいで
過剰に反応するお前の方がよっぽどおかしい。スルーしてればとうの昔に流れて
いたのにそうやって何度も蒸し返すからいつまで経っても終わらないことにまだ
気付かないのか?

204 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/06(金) 23:00:43 ID:PeG66ZW30]
>>202

素人なんでお聞きしたいんですけど、Intel Macでインテルコンパイラを使うって、
具体的には、どんな感じなんですか?

たとえば、コマンドラインから、gccの代わりにインテルコンパイラを使って
ソースファイルをコンパイルしてやれば、自動的に最適化された実行ファイルが
作成されるんですか?それとも、ソースファイルそのものを書き換えてやる
必要がある?

205 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/07(土) 04:19:01 ID:Mbaa0KOK0]
>>203
理由なくあやしいって言うのと証拠なく詐欺っていうのは一緒。
理由のないネガティブな印象を流すことを中傷っていうんでしょ。
てかあやしいと思うなら理由かけばいいだけなのに。書けば問題無し。

「理由なくあやしいっていうのはおかしい」はそれだけで完結した
意見になってるから何も問題ないしもっともな意見。
俺もそう思う。あやしいと思うやつは理由を書け。書けば済むこと。以上。


206 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/07(土) 09:48:20 ID:txsrzkgq0]
まだ続いてるのかw

207 名前:名称未設定 [2006/10/07(土) 12:23:32 ID:qV67DxTe0]
まあ研究してる人間って人の悪口ばかり言って、粘着質な嫌がらせして
自分のことは屁理屈こねてる腐った人間多いから仕方ないな

208 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/07(土) 12:32:35 ID:7mrne3py0]
しつけーw

209 名前:名称未設定 [2006/10/07(土) 13:05:25 ID:vO9tt/z40]
>>201
Mathematica 6
が出るよん!

12月に東京でも発表会があるようだから行ってみればぁ

210 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/07(土) 13:55:09 ID:8TGzLkGJO]
マジですかっ
慌てて買っちまうとこだったよ
サンクス



211 名前:♪まめちしき♪ mailto:sage [2006/10/07(土) 17:07:38 ID:SZfQfhqo0]
〜/.bashrc に
alias mathematica="/Applications/Mathematica\ 5.1.app/Contents/MacOS/MathKernel"
などと書いておけば,Terminal でMathematica を呼び出すことができる.


212 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/07(土) 21:40:40 ID:XA9CYaDe0]
>>211
最近のMathematicaってXアプリなの?昔は違ったと思うけど。
もしただのCarbonとかCocoaなら、
alias mathematica='open -a "Mathematica 5.1.app"'
のほうがスマート。
こうしないと引数とれないんじゃないか?

213 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/07(土) 21:56:59 ID:7mrne3py0]
>>212

carbonだろ。
それをターミナルで使うには>211のとおり




214 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/07(土) 22:03:11 ID:XA9CYaDe0]
>>213
あ、Terminalからコマンド打ったりできんの?
へー、知らんかった。
普段Mathmaticaなんて使う分野じゃないんで、すまん。

215 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/08(日) 01:03:03 ID:aOzahh9l0]
>>214
でけるよ
emacsから使う人もいるし

216 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/08(日) 01:46:53 ID:qnUTH+m70]
98ヘェー

217 名前:名称未設定 [2006/10/12(木) 02:33:21 ID:k5h+9WYj0]
このスレの趣旨とは全然違うかもしれんが、質問させて。

Natureの英語版サイトにアクセスしてabstractやfull textを
読もうとすると時々勝手に日本語版に誘導されてしまうんだけど
これってどうして?またこれを防ぐ方法ってある?
海外にいるのでInstitutional accountは日本語版のページでは
認識されないらしく、full textが読めなかったりして鬱陶しいので
何とかしたいんですが。

218 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/12(木) 03:14:01 ID:53z43ggl0]
>>217
ブラウザ何か書いた方がいいんじゃね?
めちゃくちゃ適当なんだが、
java scriptオフにするとかじゃ駄目?

219 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/12(木) 08:18:09 ID:tJ6p1/OE0]
>>217
Natureのサイトの認証システムは出来がわるそうだよね。
個人アカウントと組織アカウントを併用してると
おかしな動作することがしばしば。
がんがんバグレポートすればいいと思うよ。
いかにもよく分かってなさそうなやつから返事来るし
すぐには改善されないと思うけど。


220 名前:名称未設定 [2006/10/12(木) 11:02:24 ID:xk2m+PoX0]
じゃあMACOSXにするか。



221 名前:218 [2006/10/12(木) 12:54:59 ID:78rWoBSU0]
すみませんでした。
OSはMacOS10.3.9、ブラウザはFirefoxとSafariを併用。
ただし同様の現象はiPapers1.0を通してNatureにアクセスしたときにも
必ずおこります。
気のせいかもしれませんが、email alertのリンクをたどってアクセスすると
起きやすい気がします。Natureの英語版ホームページから順にたどると
日本語版に飛ばされることは少ない気がします。
ブラウザとかの言語情報を自動的に読み取って日本語ページに飛ばして
いるんですかね?

222 名前:名称未設定 [2006/10/12(木) 13:27:18 ID:IRfNAMeC0]
OSX10.4.8, office v.Xなんですけど、EndnoteXのCWYWが使えません。
Word起動時にアドイン アプリケーションが読み込めませんと出て
WordからEndnoteのメニューを操作すると実行時エラー '5'と出てしまいます。
同じような方いませんか?
officeを入れ直したりEndnoteのアドインの場所を確かめたりしたけど問題ありません。
EndnoteX+Word v.Xは問題ありなんでしょうか?

223 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/12(木) 16:24:01 ID:IuC6pX3L0]
>>221
研究環境にはTigerがいいぞ。
SpotlightでPDFの内容検索は、Pantherには戻れませんって感じだ。

224 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/12(木) 20:17:27 ID:ja/YJP9y0]
素のSpotlightのは微妙に使いにくいから俺はフリーのSpotInsideを使ってる。

225 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/12(木) 22:50:14 ID:U0pJqC2n0]
>>221
Firefox なら[ツール]->[オプション]、「詳細」タブの「言語設定」で
「英語/米国 [en-us]」を一番上にしてみては。

>>222
EndNote 以外の他のアドインを全部無効にしてみては。

226 名前:222 mailto:sage [2006/10/13(金) 12:45:28 ID:sIB+ctrR0]
解決しました。
どうやらEndNote 10 CWYW Word X(アドイン)そのものが
おかしかったらしいです。
本家(USACOじゃないほう)のFAQを見たらアドインが置いてありました。
それを入れたら問題なく動くようになりました。
どうなってんだ、USACOのインスコCDは

227 名前:名称未設定 [2006/10/15(日) 23:45:30 ID:GcQuHk+40]
まてまちか6

12月のカンファレンスだかの登録者に
CDくれるって話だが

228 名前:名称未設定 [2006/10/16(月) 09:21:58 ID:1WCGOxiE0]
STATA, Rを使っている。
最近、FinkでMaximaも入れてみた。

Mathcadって、ずいぶん前から、Mac版が無くなってるんだな。ひどい。

229 名前:名称未設定 [2006/10/16(月) 10:09:44 ID:syqreopQ0]
>>228
Mathcadは無いけどMathematica CalcCenteとMapleがあるから事足りる気がする

230 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/16(月) 13:23:29 ID:3LOGBNvA0]
>>227
とうとうintel 64bit対応かな??



231 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/16(月) 23:06:41 ID:nu3DQrfD0]
Octave 使い。

今まで Fink で入れた ver. 2.7.2 使ってたんだけど、
2.9.9のバイナリハッケソ

hpc.sourceforge.net/

計算時間がチョペット早くなった気がするのと、
Octave-forge の関数が最初から入ってるのもあったのが違いかな。

232 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/18(水) 06:47:24 ID:JdLkKo1u0]
スレ違いでスマソ。

matlabにできてoctaveにできないことって、どんなこと/関数があります?

233 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/18(水) 09:47:11 ID:siQA5ip40]
>>232
たくさんあり杉w

Octave + Octave-forge で基本的な関数は使えるようになるけど、
Octave-forge も完璧じゃないし。
例えば plot3 はバグが治って 2.9.9 でやっと使えるようになった。

グラフ描画が基本的に gnuplot なので、
Matlab みたいなきれいな絵はできないし、種類も豊富ではない。

それでも、タダだし、
普通の計算の基本は押さえられているので、漏れは Octave 好き。
G5 dual でブンブン計算回してる。

234 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/10/19(木) 03:27:37 ID:3GLyXHg40]
>>233

ありがとうございます。

最適化なんてどうなんでしょう?たくさんのパラメータを持つ任意のモデル(バリバリ非線形)を作り、
データにフィットさせ、MSEを最小化するようなパラメータ値の組み合わせを
みつける、とか。MatlabかOctaveにやらせたいのって、図形描画よりも
数値計算なんです。233さんの経験で結構ですが、数値計算にしぼった場合、
「Octaveにはこれがなくて困るよ」なんてのは、何かありましたか?

235 名前:233 mailto:sage [2006/10/19(木) 04:21:11 ID:NEkr3V320]
>>234
>「Octaveにはこれがなくて困るよ」なんてのは、何かありましたか?

自分は、今のところは octave + forge + 自作 で足りてる。

しかし、関数一つあるのとないので、だいぶ違うからねぇ。
関数一覧を眺めてて、「Matlab にはこんな関数があるのかよ (´・ω・`)」
とかは日常茶飯事だ。

最適化とかは、optimization toolbox とかあるみたいだし、
お金があるんであれば Matlab + toolbox に越したことはないと思うよ。

www.mathworks.com/products/optimization/

236 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/01(水) 17:36:03 ID:XzragNHz0]
DDBJのParser for unixをOS Xにインストールして使われている人はおられませぬか.

237 名前:名称未設定 [2006/11/10(金) 09:00:53 ID:0ngoLgZN0]
論文管理について語らないか?
というか、先人の知恵を教えてくれないか?

金がもったいないので、自分はiTunesで管理してる。
なんだけど、bibtexに吐き出したりする機能が当然ないわけで、
そろそろ他の専門ソフトに移行しようかなと思案中。
(何百もPDFがあるので、移行するだけで一苦労なんだけど。)

現状は、
アーティスト > 著者
アルバム名 > 雑誌名
トラック番号 > ページ
年 > 年
という置き換えでiTunesを利用中。

短所:
・ページ数が3桁までしか入力できない
・bibtexへの吐き出しができない。(AppleScript駆使すれば出来る?)
・タグを増やせない

長所:
・無料
・検索が速い
・UIがApple謹製なので美しい

皆さんの管理方法を教えて下さい。

238 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 12:25:24 ID:Sfj5EFBq0]
>237
僕はiPapersで。
ttp://homepage.mac.com/toshihiro_aoyama/iPapers/index.html

239 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 12:26:51 ID:986DIpdZ0]
Spotlight

240 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 14:08:12 ID:sQCV4z3D0]
論文て一般人は見ることできますかね。
まずは日本語の論文を見てみたいんですが、英語敷かなければそのURLを教えて頂けませんか。



241 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 16:14:33 ID:zJyn9MM+0]
Senteに一票

242 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 16:23:03 ID:Sfj5EFBq0]
>240
医学系(生物系含む)の論文だと、PubMedがメジャーな文献データベースかな。
英語です。

ttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed

検索フィールドにキーワード打ち込むと該当する文献(論文)のリストが出てきて、
リンクを開くとそれぞれの論文の概要が読めます。モノによっては全文がPDFで無料
提供されている論文もある(出版社の方針次第)ので、そういったものは概要のページ
からさらにリンクがあります。

243 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 16:34:53 ID:Sfj5EFBq0]
>240
日本語の論文だと、日本微生物生態学会の会誌が無料公開されてますな。

ttp://ci.nii.ac.jp/vol_issue/nels/AA11551577_jp.html

適当な巻号のリンクを開いて、NELSって書いてあるリンクを開けばPDFへのリンクが
あります。
学会誌を無料公開するかどうかは学会次第なので、国内の学会のページを調べてみて
学会誌を無料公開しているかどうかちくちく調べてみてください。

244 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 16:39:37 ID:iIbjevpK0]
英語論文はiPapersで管理してるけど、PMIDがついてない日本語論文とかの管理が難しい
iPapers日本語版が欲しい

245 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 18:49:35 ID:NRzu+v7J0]
>>237
BibCompanionはどう?
www.surf.nuqe.nagoya-u.ac.jp/〜nakahara/Software/BibCompanion/

246 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 18:53:23 ID:042RV+FV0]
>>242,243
ありがとう。素人だけど参考にさせてもらいます。

247 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 20:50:31 ID:tvMA9c8x0]
Bookendsは?
www.sonnysoftware.com/

248 名前:237 [2006/11/10(金) 22:00:48 ID:0ngoLgZN0]
それぞれ試用してみるかな。
iPapersは昔使ってみたんだけど、なんとなく使い心地が悪かった。
1年以上前なので、だいぶ開発が進んでいるかも。
ちなみに自分はPubMedは関係ない分野。

↓取りあえずのまとめ
【無料】
・iTunes ttp://www.apple.com/jp/itunes/download/
開発が必ず続く/BibTex非対応/タグを増やせない/トラック番号が3桁まで/日本語対応/PDFしか読み込めない
・iPapers ttp://homepage.mac.com/toshihiro_aoyama/iPapers/index.html
PubMed対応/BibTex非対応?
・BibCompanion ttp://www.surf.nuqe.nagoya-u.ac.jp/~nakahara/Software/BibCompanion/
BibTex対応/日本語対応
・Spotlight
数百超えると管理できないかと

【有料】(括弧内はアカデミックor学生価格)
・Sente ttp://www.thirdstreetsoftware.com/
$129.95($89.95)/PubMed対応/BibTex対応
・Endnote ttp://www.usaco.co.jp/products/isi_rs/endnote.html
52,290円(20,790円)PubMed対応/BibTex対応/日本語対応
・Bookends ttp://www.sonnysoftware.com/
$99($69)/PubMed対応/BibTex対応

249 名前:237 mailto:sage [2006/11/10(金) 22:03:06 ID:0ngoLgZN0]
(続き)
使ったことないものは、説明が間違ってるかも。
使用してるソフトの簡単なレビューとか書き込んでくれると嬉しい。
何個か使い込んで、このソフトは他よりここが優れてる、とか。

ちなみにiTunesでPDF以外の文書を登録する裏技はあって、
例えばパワポなんかだと拡張子を.pdfに付け替えて登録してしまう。
で、登録されたあとにcmd + RでFinderで実体を探し出して、
「情報を見る」の「このアプリケーションで開く」をパワポに設定してしまう。
そうすれば、.pdfという拡張子だけど、パワポで開いてくれるようになる。
気持ち悪いやり方だけどね。

250 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 22:10:03 ID:Sfj5EFBq0]
>248
iPapersはExportにBibTeX Formatってのがあるでー。
PubMed使わないのだったらiPapersにはあんまりうま味ありませんな。



251 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 22:46:24 ID:BXMvCH/+0]
他スレで紹介されてたが、yepを強力に推薦しとく。
www.yepthat.com/
こいつはぶちゃけpdfに特化したiTunesだ。
強力な内蔵プレビューとタグ機能で、とりあえず名前も付けずに
文献大量ダウンロード、後で必要な所を探して読もう、
というズボラ研究者にお勧め。

252 名前:名称未設定 mailto:sage [2006/11/10(金) 23:10:36 ID:jZBvmOBE0]
>>237
BibDesk
無料 BibTex対応 PDF以外もOK
ttp://bibdesk.sourceforge.net/
PubMed 使うひとは Reference Miner と併用すると便利
ttp://www.sonnysoftware.com/






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