sourceforge.net/docman/display_doc.php?group_id=1&docid=4297#permissions によると、 「All content on the project web servers that needs to be written by the project web servers must be world-writable and be placed under the /tmp/persistent directory (create a subdirectory for use by your project files).」 なので、 /tmp/persistent/omaemona を作って、そこに pukiwiki を置くようにしたところ、編集できるようになったっぽいです。