Macで学術系ソフト研究室のMac・4

Macで学術系ソフト研� ..

910:901
08/11/22 05:14:55 iiqO7YyN0
>>909
普段使わないもの覚えておいてどうすんだよ。
大学受験生？

911:名称未設定
08/11/22 07:29:10 ezRZpoJ50
あのさ、統計使って論文書くのにp valueは基本中の基本のわけ。
理系ではp value 使ってない論文探す方が難しいくらいだ。
もちろん文系でも統計使えば必ずと言って使う。

901が使わないのは、別にかまわないしそう言う分野もあるだろうが、
決して多数派ではないわけ。

学術系のスレなんだから、使わ無くったってp valueは常識。

一般人だってπなんか普段使うこと無いけど常識だろ？
知って無くてもかまわないが、その用語を普通に使ったやつを
視野狭窄呼ばわりってどんだけ恥ずかしいやつだよ。
てこと。

普段ならスルーだが、人の良いだろう902が理不尽にあやまらされてた
ので皮肉っただけ。
ただしp valueは相関係数とは違うからな。

質問なんだけど
0.05を.05と表記するのは必ずしもアメリカの常識では
無いと思うんだけど（医学臨床および生物基礎系しか読みませんが）
そう言う方向に動いてるんですか？

912:901
08/11/22 07:48:22 iiqO7YyN0
>>911
>理系ではp value 使ってない論文探す方が難しいくらいだ。
もう、アホかと。マジでお前が視野狭窄じゃねーか。

URLﾘﾝｸ(www.sciencemag.org)
はい。今回のScienceからでも、p value使ってる論文の比率調べてみろよ。
ScienceとかNatureなら話題が理系全般だから、
p valueを論文で使用するのがどれだけ一般的か分かるだろ。

だいたい、>>906ではSPSSに対して視野狭窄って言ってるんだけど。
ちゃんとレス読んでから人のこと煽れよ。

>>900に何か解決策を提示するならまだしも、
煽るだけのレスつけて楽しいか？

913:名称未設定
08/11/22 08:08:30 ezRZpoJ50
スレ汚しなんで最後にするが、

scienceやnature（の中身を）読む人間でp value知らない人間なんて
あり得ないことはわかるか？

というかここでnature,scienceを引っ張ってくるおまえが、
何でp value知らなくって噛みついてくるかが謎だよ。

SPSSについて言わせてもらえば、統計解析ソフトの中で
横綱級に有名なソフト名だから、そこに何の注釈を加えりゃいいんだよ。

単純に902にあやまっとけって話だ。

914:名称未設定
08/11/22 08:17:04 ezRZpoJ50
おっと、911の最後の質問は、902,904へのまじめな質問です。
911とわけた方が良かったな。

915:901
08/11/22 08:21:59 iiqO7YyN0
>>913
だから、お前の分野ではSPSSは横綱級だろうけど、
それを理系全般に引っ張ってくることが視野狭窄だって言ってるの。
すごい負けず嫌いというか、人にそういうところを指摘されるとカッとする人なんだな。

>scienceやnature（の中身を）読む人間でp value知らない人間なんて
>あり得ないことはわかるか？
>
>というかここでnature,scienceを引っ張ってくるおまえが、
>何でp value知らなくって噛みついてくるかが謎だよ。

話を誤魔化すしさ。
>はい。今回のScienceからでも、p value使ってる論文の比率調べてみろよ。
これに答えてくれよ。

916:名称未設定
08/11/22 09:59:00 sj/TjCcH0
さっきから言ってることって、
MSOfficeって何だよ、
そんなの普通知らねーよ、
って感じに近い。

917:sage
08/11/22 10:40:04 kP1iomI/i
みんな釣られすぎですよ
p value知らないヤツなんているわけないだろ

918:名称未設定
08/11/22 10:45:01 kP1iomI/i
sage失敗
失礼

919:名称未設定
08/11/22 11:18:46 yBJBcImL0
横から失礼
>901は、>900の質問に関して、SPSSとかの言葉を省けば普通のスレでも
(例えばiWorkスレ）答えられるんじゃない？と言いたかったのではないか？
あ、ゴメん、これで最後ね

920:名称未設定
08/11/22 11:34:22 m2f/20H90
SPSSはともかく、p valueは少しでも統計をやっていれば普通に知っているのでは？
別にNatureやScienceに限らず。
「俺の知らん単語を使うな」と息巻く奴の気持はわからない。

ところで、Numbersで作って、ExcelなりOpenOfficeなりに書き出すやり方では
だめなのでしょうか？

921:名称未設定
08/11/22 11:47:54 74SRDO0B0
もうp valueのことはいいよ　(´_｀)

922:名称未設定
08/11/22 11:56:18 W0CASI+80
>>906
>p valueってのは、相関係数か。思い出した。
>学部で習ったが、あんなもんは俺の分野じゃ使わない。

確率や統計的検定を使わない分野，ってことだよね。
理系だとなにかな？　あるかな？

923:名称未設定
08/11/22 11:57:57 W0CASI+80
まあ研究に統計を使ってるけど統計をまったく理解してない奴と
いうのも理系にはたくさんいる。農学とか工学だとそっちが普通で
検定やってるくせにp値を知らないとか充分あり得る。

924:名称未設定
08/11/22 12:28:42 +2YArN0f0
元レスの目的。
Numbers 上で計算処理しないんであれば、tsv fomat にして、数値と判断させたくないセルの
先頭に ' 付けとけばいいだけじゃねえの？
perl -i.bak -lpe 's/(?<=\t|^)0?.\d+(?=\t|$)/\047$1/g' HOGE.tsv
その後読み込ませれば、テキストセルと判断されるから御自由に。

Numbers スレなり osxhints あたりなりで、「defaults command ねえか？」%

925:名称未設定
08/11/22 12:29:50 +2YArN0f0
でも良いと思うけどさ。

が何故 % になるんだよ…

926:名称未設定
08/11/22 12:31:33 +2YArN0f0
しかも間違えてるし…
perl -i.bak -lpe 's/(?<=\t|^)0?(\.\d+)(?=\t|$)/\047$1/g' HOGE.tsv

スレ汚しごめん。

927:名称未設定
08/11/22 15:13:42 9ffgxbf+0
化学系だけど統計処理なんて全然使わないよ。

928:名称未設定
08/11/22 20:53:38 BhKxVJUR0
なんかもりあがってるけど、
俺、芸術系なんだけど、もちろん統計とかシラン。
でもこのスレはずっと追いかけていて役にたってる。

専門ってさ、そのなかだと支配的な知識ってあるけど、
そこはそこ、もうすこし他人の気持ちを考えることが
できないと、排他的な人格になってしまうんではないだろうか。

929:名称未設定
08/11/22 22:44:32 xI/5TG1a0
化学系はWordと電卓だけで論文書けたりするからなあ

逆にChem[Bio]Drawだけでスライドやポスター作る輩もいるしw

930:900&902&905
08/11/23 01:42:17 8uoBLoK90
>>908
お、なんか裏技ですね。ありがとうございます。
ほとんどのケースではうまく行きそうでしたが、
値が1.0ちょうどの場合に.0になってしまうのと（ほんとにレアですが）
値の後ろにsignificanceを表すアステリスクがついている場合があるので
そこはいちいち直さなきゃならなそうです

>>911
自分はただの修士院生なのでわかりません。
しかも分野はどちらかと言えば文系（言語系）ですので。
ただ、>>905にも書いたように、APAでもp valueなど以外では０を付けなければならないようですので
ただの例外だと思います

>>920
Excelに書き出してみましたが、ご丁寧にゼロはそのまま残りました。

>>924-926
残念ながら自分には理解できそうにありません。マクロとかそういう話でしょうか。
どうもありがとうございます。

やはり、どうもうまい話はなさそうです。
windowsを使うか、MS office for macの導入を検討します。

931:900&902&905
08/11/23 01:43:44 8uoBLoK90
あーsage忘れた
ごめんなさい

932:名称未設定
08/11/23 02:00:19 RUlsp2x00
何をしようとしているのかよく分からんが，何故SPSSから直截Wordでもpdfで
もただのtextでも出力できるのに，わざわざNumbersを使わないといけないの
かな?　君は何をしようとしてるのかをもっと具体的に述べてくれ．

933:名称未設定
08/11/23 02:11:52 IN8oCqSC0
SPSSのレポートは汚すぎるし、最終アウトプットとしては使えないと思うが。
それに、regressionの結果を示すテーブルなら、
表計算ソフトを使って作らないか？

934:名称未設定
08/11/23 02:37:43 RUlsp2x00
うーん，ピアソンの相関係数なら，p valueと相関係数そのものかそのsquare
で充分じゃないかな．logistic regressionなら，仰るとおり，p value以外に
オッズ比やら95%信頼区間やらで，綺麗な表が必要だな．multiple regression
もそうか．でも，SPSSの出力ってそんなに汚い?　pdfで出力して必要なところ
を切り出してKeynoteに貼り付ければ，プレゼンレベルなら問題ないと思うけど．
論文となると細工が必要なんで，また別の話だが．まぁ，この辺は個人的な審
美観の問題か．

935:名称未設定
08/11/23 03:44:53 IN8oCqSC0
>>930
Excelだと、できるよね。
セルの書式でCustomを選択して、
#,##.000
などとする。
桁数を増やしたいときは後ろにゼロを増やす。

936:名称未設定
08/11/23 08:15:06 9OxHWhTm0
>>934
相関係数の有意性検定ってのは多くの場合ほとんど無意味だから
相関係数そのものとサンプルサイズを示せば充分。
APAマニュアルを使う分野ならむしろ分散分析とか差の検定だろう。

937:900&902&905
08/11/23 08:24:08 8uoBLoK90
>>932
えーと、単純に、論文をmac環境で書いているので
SPSSからWordに書き出したものを、Numbersで読み込んで
そのNumbersの表を論文(Pagesで書いてます)に貼りつけたいんです。

SPSSレポートをそのまま論文内で使えないのはみなさんの言うとおりです。
汚いというよりは、SPSSの出す数値を論文内ですべて掲示する必要はないので。

具体的には、スピアマンの順位相関とt検定を使ってます。

938:名称未設定
08/11/23 10:24:45 afianzu90
>>930
なんで>>908じゃいけないのか分からん。

>値が1.0ちょうどの場合に.0になってしまうのと（ほんとにレアですが）
>値の後ろにsignificanceを表すアステリスクがついている場合があるので

どっちにも対応したようにPagesの関数を使えばいいじゃん。
1.0丁度なら、場合分けさせればいいし、
アスタリスクがついてるなら、それもう数値じゃないじゃん。
ともかく、そういう例外に対応した場合わけすればいいだけ。
Helpの関数のところ熟読しろ。
どうせ見た目の整形がしたいだけで、そのcellを使って解析しないんだろ？

939:名称未設定
08/11/23 15:30:30 izlOKrNf0
>>937
t-検定だったら，t値，自由度，例数，p value, 各群の平均値と標準偏差ぐら
いだよね．Spearmanだったら，相関係数その物と例数とp valueぐらいだろ？そ
れぐらいだったら，手書きで写しても，あっと言う間にできちゃうんじゃないの？
そんなに手間暇かける理由があるの?　それとも，まさかとは思うが，多群の多
重比較をするために，t-検定を繰り返しやっているというようなことはないよ
ね?　どうも分野が違うのでよく分からんが（ちなみに俺は医学系です）

940:名称未設定
08/11/23 17:45:11 izlOKrNf0
>>937
もうひとつ分からんのが，何故parametricとnonparametricを混ぜて統計解析
してるのか，だな．まぁ，対象がそれぞれ違うのだろうが．．．

941:名称未設定
08/11/23 18:32:55 V9hfxCQ50
BibDeskを使ってPubMedとか外部データベースを検索すると
50件までしかリストしないのだけど、これを解決する良い方法
ないですか？

942:名称未設定
08/11/23 19:14:14 izlOKrNf0
もう一回サーチボタンを押してごらん，押す度に検索数が増えるはずだよ．マ
ニュアルをよく読もうよ．

943:名称未設定
08/11/23 20:54:49 V9hfxCQ50
>>942
ありがとうございます！！
一応、ヘルプとネットは当たったのですが、力足りず、、。
かなり助かりました。

944:名称未設定
08/12/04 13:28:20 h+YCrGnz0
久しぶりにLeopardでDataThief使おうと思って調べたら、
（以前はClassicで使ってた）
いつのまにかJavaアプリになってたのね。
URLﾘﾝｸ(www.datathief.org)

945:名称未設定
08/12/05 00:07:49 sIse8YHX0
>>944
DataThiefって，一体どんな時に使うの?　人の論文のグラフのデータを読み込
んで何か良いことがあるのだろうかと，以前から不思議なのだが．勿論，自分
の論文には使えんわな．以前に自分で書いたグラフの元データを紛失して仕方
なく，と言うのはあるか．すまんが，後学のためにご教示願う．

946:944
08/12/05 02:04:44 88luKFA70
>>945
今回俺が使った目的は、縦軸と横軸を入れ替えて、
さらにLog-LinだったのをLin-Linに直した。
自分の研究の測定結果と比べるため。
もちろん、内輪での閲覧用に限る。

論文化するなら、著者に直接データ点をもらうでしょうね。

あとは、業者のカタログのグラフとかね。
カタログは配布してるけど、データ点としては渡せませんってのは、ままある。
そういう場合は仕方なく購入前に点を読み取って、
どういう性能が期待されるかを計算したりとか。

947:名称未設定
08/12/05 11:32:33 KdMMkoXs0
アナログチャートしか出せない古いCVとかESRのデータをデジタルに取り込むのに使ってた

948:kur
08/12/05 15:29:43 L0WzV7PA0
はじめまして．
階乗を求めるプログラムを書いていて気づいたんですけど，
電卓（mac純正）の計算結果が明らかにおかしいんです．
どうやら100付近の階乗でのみ値がずれるようです．

自作プログラム，エクセル等と比較したところ，
100！はおよそ9.3326E+157なのですが1.8446e+146となります．
誤差とは呼べないほどずれるので気になります．

このバージョンのみのバグでしょうか？？

949:名称未設定
08/12/05 16:06:55 kEFLCkQU0
>>948
で、どのバージョンなんだよw
OS X 10.5 caluculator 4.2
で100!は
9.332621544394418e+157
R 2.72で
> factorial(100)
[1] 9.332622e+157
だから、caluculatorの値は正常だよ

950:kur
08/12/05 16:22:51 L0WzV7PA0
>>949
すいませんw
OS X 10.3.9です．
電卓は3.1 (v3.2.1)です

このmacだけなんでしょうか？

951:名称未設定
08/12/05 17:02:15 8tdNs20r0
安心しろ、手元の10.3.9で確かめたら確かに1.8446e+146になったぞ。
多倍長整数と浮動小数点に関してはダメっぽいな > 3.1(v3.2.1)

952:名称未設定
08/12/05 18:54:47 /9cG2wob0
そんなんもん
まてぃまてぃか
で　やらんかい!!

953:名称未設定
08/12/05 20:27:06 +Ghpai3r0
>>952
そういう問題じゃないだろw

科学計算でも y^x では10.0^128 でオーバーフローって出る。
でも、10.0^127 の結果に *10.0 をしたら 1e+128 ってでるなぁ。謎だ。
しかしこの手の話は、開発系のスレの方が良いかと思うがいかがなものかな？

954:kur
08/12/05 22:10:08 z+v5G+vh0
105!を越えた辺りからはまた正しいんですよ
オーバーフローではなさげ??

とりあえず結果が信用出来ないんで
他ので計算することにします．

ありがとうございました！！

955:名称未設定
08/12/06 06:56:32 geC8h6Fi0
すたーりんぐの公式でいいじゃん。

956:名称未設定
08/12/08 00:28:09 73jIOajD0
>>946
>>947
教えてくれて感謝．なるほど，業者のデータねぇ．当方は医系だけど，そこま
でやる必要性を感じたことがないので，感心しました．

957:名称未設定
08/12/10 21:19:09 NshCep0m0
　EndNote X2 を購入あげ。

958:名称未設定
08/12/11 21:28:52 /a19W8onP
↑金持ちいぃ

959:名称未設定
08/12/15 13:44:03 GTOV88aS0
pKizzyの検索って語順にシビア過ぎませんか。
例えばComplete sequence of DNA・・・・ってタイトルの論文は
「DNA sequence」，「sequence DNA」という検索では出てこない。
そういうものなのでしょうか？使い方がおかしいのかなぁ

960:名称未設定
08/12/18 23:28:22 Bw5JXaSK0
test

961:名称未設定
08/12/24 15:13:00 /8OZIBwU0
あれ、TeX 関連のスレ落ちちゃったのかな？

962:名称未設定
08/12/24 20:36:33 RRmuzjfW0
>>961
12月2日で落ちました。

963:名称未設定
08/12/25 20:29:14 bvJ/1SKZ0
ライフサイエンス辞書をLeopardの辞書にする。
URLﾘﾝｸ(blog.hryk.info)

これすごく便利そうなんだけど
必要なスキルが高すぎてちんぷんかんぷん。
xmlのコンバートどころか、最初のdumpですでに躓いてしまった。。。

どなたか、xmlファイルか、ビルドした辞書をアップする勇者はいませんか？？？？

964:名称未設定
08/12/25 21:07:08 YtQUrxGwP
公式サイトで配布してなかった？

965:名称未設定
08/12/25 21:15:59 jC1CCwNf0
>>962
thx。落ちちゃったのか～

966:名称未設定
08/12/25 23:09:09 nyS1eW5c0
>>964
うちもたいした手間無く使ってるということは、夏休みに配ってたやつ？

967:名称未設定
08/12/26 09:34:21 X6Uz9Vjy0
>>963ですが、、、

勢いついでにLSDのサイトから要望メールを出したところ
確かに夏にテスト版を公開していたそうで、
来月には正式版がリリース予定だと
プロジェクトリーダーご本人から返事をいただいてしまいました。

正座して待つことにします。

968:名称未設定
08/12/26 14:51:38 X3qx8xNU0
LSDのサイト・・・違法サイトかと思ったよ

969:名称未設定
08/12/28 00:02:47 Qz1j4RiE0
これはこれは研究の合間に大変なものを作ってしまいましたね。

970:名称未設定
09/01/03 17:30:42 BGMwsktA0
limited slip differentialを開発するのが違法なのか？

971:名称未設定
09/01/04 07:07:46 Y59OS0iE0
>>970
もっと日頃から面白い発言しないと。

972:名称未設定
09/01/04 20:44:46 UHzQfnZ00
ペコペコするなよ。

973:名称未設定
09/01/07 10:41:00 IK6uZYJi0
iWork09のPagesで、EndoNoteX2&Mathtypeに対応だって。
ただ、出版社側でPagesのテンプレートを用意してくれないと論文には使えないな。

974:名称未設定
09/01/07 15:06:09 Q2S4mP+V0
>>973
E=mc^2ワロタ
体験版で確認した。挿入メニューにあるな。

Word形式書き出しでの警告メッセージ
>書き出されたMathType数式は編集できません
惜しい。だが、十分だ。

975:名称未設定さんてえいて
09/01/08 01:24:38 WUXc83f30
たちたかし　こないなあ俺右ぐうわきがなんやけど、チンチンと足まは
ええパフューム設定にしてもろてたのに移動にあるんじゃないか

976:名称未設定
09/01/08 03:44:50 sgMrUDc90
痴呆の方?

977:名称未設定さんてえいて
09/01/08 04:09:20 WUXc83f30
弱勉

978:名称未設定
09/01/08 06:51:30 xvVRvW9X0
>>973
　本格的にMicrosoft Office2008から脱却する理由が出来たな。
Mathtypeへの対応は、編集可能なオブジェクトとしてではなく、あくまでも画像なのだな。

　さて、年度末の研究費で購入するとしますか。あとは、mathtype 6の日本語化か・・・

979:974
09/01/08 15:52:04 aF8eBSjK0
>>978
えっと、Pages内でなら再編集可能。混乱させてスマソ

挿入メニュー->MathType数式選択で本文カーソル部に数式E=mc^2が挿入され、
MathTypeが起動してE=mc^2が入ったウインドウが開く(ウインドウタイトルは
Equation from Pages)。あとは数式を好きに変えてウインドウを閉じれば本文中の
数式が変更される。ダブルクリックで再編集可能。

要はWord-MathTypeの連携と同じ事がPages-MathTypeで可能になった。
ついでに、
NumbersとKeynoteにもMathType数式挿入メニューができたよ。当然再編集可能。
拡大しても線が途切れたりしないみたい。

980:名称未設定
09/01/12 18:44:56 stGDR3HC0
このスレ医療関係者少なさそうな上Mac用ってわけじゃないけど
URLﾘﾝｸ(www.visiblebody.com)
はおもしろい
プレゼンでよく使うけど初見の人は必ず驚いてくれる

981:名称未設定
09/01/12 21:16:40 At4t+NDI0
>>980
これは面白いですね
早速登録させてもらいました

982:名称未設定
09/01/12 23:19:02 dMytQSJt0
>>980
それオフラインで使えないのかな